一种基于全基因组序列分析不产真菌毒素的真菌菌株安全性评价方法

摘要

一种基于全基因组序列分析不产真菌毒素的真菌菌株安全性评价方法，属于微生物发酵技术及食品安全领域。本发明以生物信息学的方法，主要针对真菌毒素的合成代谢途径及关键基因分析，包括PKS、NRPS与PKS-NRPS混合代谢途径，萜类化合物代谢和其他代谢途径等，基于已测序完成的真菌全基因组数据，分析真菌是否具有产真菌毒素的潜在能力，评价真菌在食品工业应用中发酵产品和微生物菌种的安全性。结果表明，华根霉CCTCCM201021基本不具备产目前已知的真菌毒素的关键基因或合成能力，其发酵产品是相对安全的。而黑曲霉（Aspergillusniger）等曲霉属真菌中一些菌株存在着部分毒素合成关键基因簇，需进一步分析判断菌株安全性。该方法具有重要的指导和应用价值。

主权项

一种基于全基因组序列分析不产真菌毒素的真菌菌株安全性评价方法，其特征在于该方法包括以下步骤：（1）基于真菌全基因组序列数据进行基因预测与注释；通过Augustus软件与Genemark软件工具分别对测序后全基因组序列数据进行基因预测与编码区分析，将预测基因序列与各数据库NR、PFAM、CDD、KEGG、COG、SwissProt及TrEMBL进行比对，获得相应的功能注释信息；（2）针对各种真菌毒素合成代谢骨架途径和特异途径及相关基因进行全基因组比对：所述针对的真菌毒素为：根霉素、黄曲霉毒素、杂色曲霉素、伏马毒素、桔霉素、根瘤菌素、环匹阿尼酸、单端孢霉烯族毒素这些已报道的真菌毒素；所述合成代谢骨架途径和特异途径为：包括聚酮合酶polyketide sythnase的PKS途径、非核糖体多肽合成酶non‑ribosomal peptide synthetase的NRPS途径、PKS‑NRPS混合代谢、萜类化合物代谢，上述的单个或多个共同作用途径进行全基因组比对分析；（3）分析该真菌菌株是否具有产真菌毒素的完整的代谢途径和关键基因，评价其产真菌毒素的潜在能力，进而评价该真菌在食品工业应用中发酵产品和微生物菌种的安全性。