发明名称 在DNA水平鉴定绞股蓝并与乌蔹莓区别的方法
摘要 本发明公开了一种在DNA水平鉴定绞股蓝并与乌蔹莓区别的方法,其特征在于:利用药用植物葫芦科绞股蓝DNA特征性片段SCAR标记克隆测序的结果,设计绞股蓝SCAR标记的特异引物对WJS-T1和WJS-T2,根据葫芦科绞股蓝18S rRNA保守区设计内参引物对WHL-18S-C1和WHL-18S-C2,组成PCR复合体系1,应用降落PCR程序扩增葫芦科绞股蓝DNA,得到359bp和293bp两条区带;再根据葡萄科18S rRNA保守区设计内参引物对WPT-18S-C1和WPT-18S-C2,与扩增葫芦科绞股蓝SCAR标记的特异引物对WJS-T1和WJS-T2,组成PCR复合体系2,应用降落PCR程序扩增葡萄科乌蔹莓DNA,得到1条葡萄科18S rRNA 177bp区带。从而对药用植物葫芦科绞股蓝进行DNA水平鉴定,并与形态上易与葫芦科绞股蓝混淆的葡萄科乌蔹莓相区别。
申请公布号 CN102191333B 申请公布日期 2013.09.04
申请号 CN201110139269.4 申请日期 2011.05.27
申请人 广西医科大学 发明人 吴耀生;周娟;罗育
分类号 C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 广西南宁汇博专利代理有限公司 45114 代理人 邹超贤
主权项 1.一种在DNA水平鉴定绞股蓝并与乌蔹莓区别的方法,其特征在于:利用药用植物葫芦科绞股蓝DNA特征性片段SCAR标记克隆测序的结果,设计葫芦科绞股蓝SCAR标记的特异引物对,结合葫芦科绞股蓝和葡萄科乌蔹莓植物各自的18SrRNA基因保守区设计引物对做为内参,分别组合成PCR复合体系1和PCR复合体系2进行扩增,对扩增产物进行电泳分析,从而对药用植物葫芦科绞股蓝进行DNA水平鉴定,并与形态上易与绞股蓝混淆的葡萄科乌蔹莓相区别;所述的PCR复合体系1,包含扩增葫芦科绞股蓝SCAR标记359bp片段的引物对WJS-T1和WJS-T2,扩增葫芦科绞股蓝18SrRNA293bp片段的内参引物对WHL-18S-C1和WHL-18S-C2,应用降落PCR程序扩增葫芦科绞股蓝DNA,得到两条葫芦科绞股蓝的359bp和293bp区带,建立的过程如下:(1)采用生物信息分析方法,筛选出19条10merRAPD随机引物,建立RAPD分析体系,找出葫芦科绞股蓝共有的SCAR分子标记J-750;(2)对已获得的葫芦科绞股蓝共有的SCAR分子标记J-750进行克隆测序,获得8份不同来源的葫芦科绞股蓝部分特征DNA序列,长度在766~770bp范围,经采用NCBI的Blast软件分析,获得8份不同来源的葫芦科绞股蓝J-750均为一段新克隆的尚未在NCBI登录的植物DNA序列;(3)利用Oligo6软件针对绞股蓝SCAR分子标记J-750设计特异引物对WJS-T<sub>1</sub>和WJS-T<sub>2</sub>,建立PCR体系扩增葫芦科绞股蓝DNA,扩增得到长度为359bp的特异区带;(4)根据葫芦科绞股蓝18SrRNA基因保守区设计引物对WHL-18S-C<sub>1</sub>和WHL-18S-C<sub>2</sub>,建立PCR体系扩增葫芦科绞股蓝DNA,扩增得到一段长度为293bp的葫芦科绞股蓝18SrRNA基因保守区共有带;(5)将葫芦科绞股蓝SCAR分子标记引物对WJS-T<sub>1</sub>和WJS-T<sub>2</sub>与18SrRNA基因保守区引物对WHL-18S-C<sub>1</sub>和WHL-18S-C<sub>2</sub>组合,建立PCR复合反应体系1,采用降落PCR程序扩增葫芦科绞股蓝DNA模板,PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳分析得到两条区带,其中1条为359bp的葫芦科绞股蓝SCAR特异带,另1条为293bp的葫芦科绞股蓝18SrRNA基因区保守带;所述的PCR复合体系2,包含扩增葫芦科绞股蓝SCAR标记359bp片段的引物对WJS-T<sub>1</sub>和WJS-T<sub>2</sub>,扩增葡萄科乌蔹莓的18SrRNA177bp片段的内参引物对WPT-18S-C<sub>1</sub>和WPT-18S-C<sub>2</sub>,应用降落PCR程序扩增葡萄科乌蔹莓DNA,得到1条葡萄科乌蔹莓的18SrRNA177bp区带,建立的过程如下:(1)根据葡萄科18SrRNA基因保守区设计引物对WPT-18S-C<sub>1</sub>和WPT-18S-C<sub>2</sub>,建立PCR体系扩增葡萄科乌蔹莓DNA,得到一段长度为177bp的葡萄科乌蔹莓18SrRNA基因保守区共有带;(2)将葡萄科乌蔹莓18SrRNA基因保守区引物对WPT-18S-C<sub>1</sub>和WPT-18S-C<sub>2</sub>,与葫芦科绞股蓝SCAR分子标记特异引物对WJS-T<sub>1</sub>和WJS-T<sub>2</sub>组合成PCR复合反应体系2,采用降落PCR程序对葡萄科乌蔹莓DNA模板进行扩增,PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳分析,得到1条177bp的葡萄科乌蔹莓18SrRNA基因保守区带,无葫芦科绞股蓝SCAR片段359bp区带;所述的引物对是:<img file="FDA00003089946200021.GIF" wi="1958" he="526" />。
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