发明名称 |
一种G蛋白偶联受体家族的分层分类方法 |
摘要 |
本发明涉及一种G蛋白偶联受体家族的分层分类方法,包括:(1)获取G蛋白偶联受体序列数据及相应的球蛋白数据,对数据集进行去冗余处理,采用二肽组成表示G蛋白偶联受体,采用最近邻算法构建分类器,建立7水平分层分类模型;(2)对待识别G蛋白偶联受体进行识别和分类。本发明能够方便、快捷地对G蛋白偶联受体进行识别和分类,具有较高的预测准确率,性能稳定可靠;本发明适合于大规模识别生物蛋白质组中的G蛋白偶联受体,并能将G蛋白偶联受体分配至具体的亚型,在G蛋白偶联受体的功能分类研究中具有很好的应用前景。 |
申请公布号 |
CN103258146A |
申请公布日期 |
2013.08.21 |
申请号 |
CN201310176146.7 |
申请日期 |
2013.05.13 |
申请人 |
中国人民解放军第二军医大学 |
发明人 |
贺佳;高青斌 |
分类号 |
G06F19/24(2011.01)I;G06F19/28(2011.01)I |
主分类号 |
G06F19/24(2011.01)I |
代理机构 |
上海泰能知识产权代理事务所 31233 |
代理人 |
黄志达 |
主权项 |
一种G蛋白偶联受体家族的分层分类方法,包括:(1)获取G蛋白偶联受体序列数据及相应的球蛋白数据,对数据集进行去冗余处理,采用二肽组成表示G蛋白偶联受体,采用最近邻算法构建分类器,建立7水平分层分类模型;(2)对每条待识别的蛋白序列进行判别分析,若待识别蛋白被判别为球蛋白,则分类过程结束;若判别为G蛋白偶联受体,则自动进入下一层,进行功能家族分类;若待识别蛋白被判别为味觉受体家族,则分类过程结束;若判别为其他家族,则进行子家族分类;完成子家族分类之后,进一步细分至具体类型;最终根据训练样本将待识别蛋白分至具体亚型。 |
地址 |
200433 上海市杨浦区翔殷路800号 |