发明名称 一种滤膜辅助分离生物样本中糖蛋白全O-连接糖链及其鉴别方法
摘要 本发明提供了一种滤膜辅助分离生物样本中糖蛋白全O-连接糖链及其鉴别方法,以解决现有技术反应效率较低、可鉴定的糖链种类较少的问题。本发明利用8~12KD滤膜的分子筛效应,将从糖蛋白上释放的糖链与蛋白分离,在8~12KD分子筛上糖蛋白的O-连接糖链经β-消除反应释放,通过清洗、反复离心的方法使O-连接糖链流出,蛋白仍保留于滤膜上,从而一步实现了O-糖链的分离。该方法分离糖链效果明显,并避免了因非特异性吸附和化学反应带入副产物;反应效率高、反应步骤简明。
申请公布号 CN102768132A 申请公布日期 2012.11.07
申请号 CN201210219469.5 申请日期 2012.06.28
申请人 西北大学 发明人 李铮;杨刚龙;马恬然;王秦哲
分类号 G01N1/28(2006.01)I;G01N1/34(2006.01)I;G01N27/64(2006.01)I 主分类号 G01N1/28(2006.01)I
代理机构 西安智邦专利商标代理有限公司 61211 代理人 陈广民
主权项 一种滤膜辅助分离生物样本中糖蛋白全O‑连接糖链的方法,包括以下步骤:(1)蛋白样品的预处理取蛋白样品加入超滤管并置于配套的离心管中,进行离心,再加入弱碱性清洗液,再次离心从而尽可能去除杂质;另取一离心管,将8~12KD的超滤管倒置于该离心管中,然后离心,收集离出的蛋白,用Bradford方法定量,最后定容至1~5mg/ml,即得到定容的蛋白溶液;(2)定容的蛋白溶液中糖蛋白全O‑连接糖链分离将定容的蛋白溶液加入另一8~12KD的超滤管并置于配套的离心管中,进行离心,加入等体积的16M尿素溶液,振荡混合,离心;再加入8M尿素溶液至超滤管中,离心,弃去收集管中的流出液;然后加入10~100mM的DTT(二硫苏糖醇)溶液并振荡混合,56℃静置孵育,离心;再加入10~100mM的IAM(碘乙酰胺)或IAA(碘乙酸)溶液并振荡混合,暗处静置孵育,离心;再加8M尿素溶液至超滤管中,离心,至少重复1次;然后加反应缓冲液至超滤管中,离心,至少重复1次;加入1M NaBH4/0.05M NaOH溶液(即NaBH4和NaOH的混合水溶液,其中NaBH4的终浓度为1M,NaOH的终浓度为0.05M);再经过40~50℃水浴后,离心;再加超纯水至超滤管中后离心,收集流出液,即得到已分离的糖蛋白全O‑连接糖链;再用冰醋酸调节pH值至中性后,冷冻干燥备用。
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