棉花纤维发育相关的GhLIM5基因克隆鉴定及应用

摘要

一种棉花纤维发育相关的GhLIM5基因克隆鉴定及应用。公开了棉纤维GhLIM5基因全长序列。GhLIM5编码了一个包含LIM结构域的蛋白。该基因的mRNA在棉纤维细胞快速伸长期中大量积累，亚细胞定位分析显示GhLIM5蛋白结合在棉花细胞的肌动蛋白纤丝上。体外高速和低速共沉淀实验表明，GhLIM5蛋白能与纤维状肌动蛋白发生共沉淀，GhLIM5能直接与纤维状肌动蛋白发生相互作用，并随着GhLIM5蛋白浓度的增大，共沉淀的效果逐渐明显，说明GhLIM5与纤维状肌动蛋白结合后能促使纤维状肌动蛋白发生成束反应，表明GhLIM5蛋白在棉花纤维发育过程中发挥重要作用。该基因可用于棉纤维品质改良分子育种研究。

主权项

一个棉花GhLIM5基因，其特征在于该基因的cDNA序列如下：ACTCCTTTTT ATACTCTCAT TTTACGTTTA TTTCTTCTTT CTTTCATAGA TCCAGGCCTT 60CTTCTTCTTC TTCTTCTTCT TCTTCTTCTT CTATCAAAGT TAATATAGGC AAATATAAGA 120GAAGAAATCG AATTAAAGTT GATCCGTGAA ACTAGATAAA GAACAGTACG ATTTGTTTTG 180ACCAAAGCAC ATTCGAGCCA TGTCATTTAT TGGTACCCAA CAGAAATGCA AGGCTTGTGA 240GAAGACTGTT TATCCAGTTG AACTTTTGTC TGCAGATGGA GTTCCTTACC ATAAATCTTG 300CTTCAAGTGC AGTCATTGCA AAGGGACACT AAAGTTGGCT AATTACTCCT CAATGGAAGG 360TGTTCTTTAC TGCAAGCCTC ATTTCGAGCA ACTCTTCAAG GAGACGGGTA ACTTCAACAA 420GAATTTCCAA TCGTCTGCAA AGGCAGCTGA GAAGTTAACT CCCGAGATGA CGAGATCACC 480AAGCAAAGCT GCCAGCATGT TTTCCGGGAC AGTCGAAAAA TGTGCTACTT GTGGCAAAAC 540TGCATATCCA CTTGAGAAGG TAACTGTAGA AGGACAGTCT TACCACAAAT CATGTTTCAA 600GTGCTCTCAT GGTGGCTGCT CTTTGAGTCC ATCAAATTAT GCAGCACTTG AAGGCATTTT 660GTACTGCAAA CATCACTTTT CCCAGCTCTT CAAGGAGAAA GGAAGCTACA ATCATCTTAT 720CAAATCCGCA TCAATCAAGC GTGCCGCTGC ATCCGTTCCT GAAGCTTGAA TACCTATTTC 780ATGTTTTTTG TTTATTCCCA TGTTTGCCGG TGTGTTTTTT TATTGATTTT TTGGATTTAT 840GCTCGGGAGG GGAACTGGAA AGAAAGAACT TGGGTTTCTT TCCGTTTTTT TGAGGCCTTG 900GTATTTGATT GATTTAAGTA GAAGTGAATG TTGTAACAGG ACTCTGTGCA AGATTTTTTA 960TGCAATCCAA ATTTGGCTCA TTTCGAATGA ATATTTTTAT AAATAATAAA AATGTTAGAT 1020ACACTACTTG GCAAT                                                  1035基因编码区从起始密码子ATG到终止密码子TGA (200–769bp)。