发明名称 | 一种根据抗体物种分类预测蛋白质抗原空间表位的方法 | ||
摘要 | 本发明涉及一种根据抗体物种分类预测蛋白质抗原空间表位的方法,包括:(1)数据收集:按照抗体物种来源信息(如,鼠源,人源等)分类收集抗原-抗体结构数据,得到分类数据集;收集蛋白相互作用结合位点的描述性特征;(2)模型建立:对于收集到的分类数据集,计算上述描述性特征,根据类间差异建立针对结合不同物种来源抗体的抗原空间表位预测模型;(3)表位预测:根据需结合的抗体物种来源选择抗原空间表位预测模型,对未知表位的抗原进行潜在空间表位预测。本发明根据抗体物种分类预测蛋白质抗原空间表位,综合运用蛋白质中氨基酸理化性质和三维空间局部结构特征,设计巧妙,显著提高预测准确性,适于大规模推广应用。 | ||
申请公布号 | CN102521527A | 申请公布日期 | 2012.06.27 |
申请号 | CN201110412679.1 | 申请日期 | 2011.12.12 |
申请人 | 同济大学 | 发明人 | 曹志伟;孙静 |
分类号 | G06F19/18(2011.01)I | 主分类号 | G06F19/18(2011.01)I |
代理机构 | 上海智信专利代理有限公司 31002 | 代理人 | 王洁 |
主权项 | 一种根据抗体物种分类预测蛋白质抗原空间表位的方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)数据收集:按照抗体物种来源信息分类收集抗原‑抗体结构数据,得到分类数据集;收集蛋白相互作用结合位点的描述性特征;(2)模型建立:对于收集到的分类数据集,计算上述描述性特征,根据类间差异建立针对结合不同物种来源抗体的抗原空间表位预测模型;(3)表位预测:根据需结合的抗体物种来源选择抗原空间表位预测模型,对未知表位的抗原进行潜在空间表位预测。 | ||
地址 | 200092 上海市杨浦区四平路1239号 |