DNA甲基化水平的测定

摘要

本发明提供低聚核苷酸和测定标准DNA甲基化水平以及测定至少两个样本之间相对DNA甲基化水平的方法。本发明采用基因组中转位子的任意分布。所公开的低聚核苷酸和方法对于尤其是临床诊断学具有重要意义。

主权项

一种测定标准DNA甲基化水平的方法，包括如下步骤：a)定量地测定在基因组DNA中转位子或其片断的存在，包括采用特异于转位子或其片段的至少一个引物对而针对非亚硫酸氢盐化的基因组DNA进行扩增，或者采用特异于亚硫酸氢盐化转位子或其片段的至少一个引物对而针对亚硫酸氢盐化的基因组DNA进行扩增，其中所述引物不包含所述转位子的差异性甲基化位置。b)定量地测定在所述相同的转位子或其片断中CpG二核苷酸的至少一个差异性甲基化的C的存在，包括采用特异于转位子或其片段的至少一个引物对而针对所述亚硫酸氢盐化的基因组DNA进行扩增，其中包含至少一个引物其包含所述转位子的至少一个差异性甲基化位置；以及c)通过在步骤a)和b)中测得的值确定所述标准DNA甲基化水平。