一种非对称环发夹型DAN探针的构建方法及其应用

摘要

本发明涉及生物芯片领域，具体涉及一种非对称环发夹型DNA探针的构建方法及应用。本发明所述的构建方法，包括以下步骤：(1)根据要检测的目标序列，构建与靶序列匹配的碱基序列A段；(2)构建与固定在芯片表面的Oligo DNA探针匹配的碱基序列B段；(3)构建C段碱基序列，其中C段碱基序列与B段碱基序列的茎臂部分的碱基序列互补；(4)将上述A、B、C段碱基序列组合。本发明绕开国内外学者为解决发夹型DNA探针在芯片表面的固定难题而在内环设计上突破，在保证了发夹型DNA探针与芯片结合时的特异性的同时，较好地解决了发夹型DNA探针在芯片表面的固定难题。使其非常高的特异性和灵敏度、液相杂交检测效率高、大规模自动化检测等独有技术优势在生物芯片领域得到充分发挥。

主权项

一种非对称环发夹型DNA探针的构建方法，其特征是，包括以下步骤：(1)根据要检测的目标序列，构建非对称发夹型DNA探针的A段碱基序列，其中A段序列是与靶序列匹配碱基序列，A段碱基序列作为环序列的一部分；(2)构建非对称发夹型DNA探针的B段碱基序列，其中B段碱基序列是与固定在芯片表面的Oligo DNA探针匹配的碱基序列，B段碱基序列一部分与A段碱基序列共同构成非对称发夹型DNA探针的整个环序列，B段碱基序列的另一部分作为茎臂与淬灭分子或者荧光分子相连；(3)构建非对称发夹型DNA探针的C段碱基序列，其中C段碱基序列与B段碱基序列的茎臂部分的碱基序列互补，C段碱基序列一端与A段碱基序列相连，另一端与B段碱基序列相对应地与荧光分子或者淬灭分子相连；(4)将上述A、B、C段碱基序列组合，再经软件验证不会形成除发夹结构外的其他二级结构，并经genbank比对后即完成非对称环发夹型DNA探针设计。