发明名称 一种快速高效准确的橡胶树品种鉴定方法
摘要 本发明公开了一种快速高效准确的橡胶树品种鉴定方法,其是依据SSR标记具有多态性高、重复性好等特性,在橡胶树品种DNA水平上产生多态性的DNA指纹图谱的特性,通过比较分析,从中筛选出各品种的特异性DNA指纹图谱,建立各品种的特征指纹库,从而将各品种逐一区分开,其过程包括:1)品种标准指纹图谱库的建立;2)品种检测与鉴定。本发明工艺过程简单,通过绘制橡胶树品种的DNA指纹图谱,建立了一种快速、简便、准确的基于DNA水平的橡胶树品种鉴别方法,可用于进行橡胶树品种鉴别,解决生产中品种鉴定难的问题,并能对橡胶树品种进行知识产权保护提供依据。
申请公布号 CN101603090A 申请公布日期 2009.12.16
申请号 CN200910118436.X 申请日期 2009.02.27
申请人 中国热带农业科学院橡胶研究所 发明人 安泽伟;程汉;黄华孙
分类号 C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 海口翔翔专利事务有限公司 代理人 莫 臻
主权项 1、一种快速高效准确的橡胶树品种鉴定方法,其特征在于:其步骤如下:1)、品种标准指纹图谱库的建立①、分别用5对SSR引物(rbm24、rbm36、rbm50、rbm55、rbm73)对全部135个橡胶树品种进行PCR扩增,在ABI3730基因分析仪上对扩增产物进行检测,获得各品种对应于每个SSR位点的各个等位位点的带型分布,并对每条带进行编号;所述引物序列为:rbm24F:atctgcataatagttgtaaccacarbm24R:agctctcatcatagtgaagttctggrbm36F:catctccacc acctacarbm36R:aggagagcaa taaccaacrbm50F:atcaagcaaa gaaacctcrbm50R:gtaagtgctc aacctctgtrbm55F:tatggctatgttctgctatgcrbm55R:ggactcttga tgattttggttrbm73F:tcggttggtttaccatgacarbm73R:acatcacatgagtgtatctgatctc②、依据引物在所有品种中的多态性指数高低将5个引物进行排序,5对引物的排列顺序为:rbm36>rbm24>rbm55>rbm50>rbm73;③、分别分析各引物在所有品种中的扩增带型,建立40个品种的特异指纹图谱,将这些品种与其它品种区分开;④、选取多态性较强的引物rbm36和rbm24形成引物组合,分析这一引物组合在剩余的95个品种中的带型,可建立55个品种的特异指纹图谱,将这些品种与其它品种区分开;⑤、选取引物rbm36、rbm24和rbm55形成引物组合,分析这一引物组合在剩余的40个品种中的带型,可建立31个品种的特异指纹图谱,将这些品种与其它品种区分开;⑥、选取引物rbm36、rbm24、rbm55和rbm50形成引物组合,分析这一引物组合在剩余的9个品种中的带型,可建立6个品种的特异指纹图谱,将这些品种与其它品种区分开;⑦、选取引物rbm36、rbm24、rbm55、rbm50和rbm73形成引物组合,分析这一引物组合在剩余的3个品种中的带型,可建立这3个品种的特异指纹图谱,将这3个品种与其它品种区分开;⑧、将用5个引物建立的135个品种的特异指纹图谱作为品种的标准指纹图谱,形成标准指纹图谱库;2)、品种检测与鉴定①、提取待测品种的DNA,分别用rbm24、rbm36、rbm50、rbm55、rbm73引物进行扩增,在ABI3730基因分析仪上对扩增产物进行检测,获得待测品种的扩增带型;②、分析单个引物在待测品种中的带型,并在标准指纹图谱库中检索,如果待测品种的带型与标准库中的某一带型相同,则认定待测品种与标准库中的某一品种相同;如果未检索到相同带型,则进行下步操作;③、分析rbm36和rbm24引物组合在待测品种中的带型,并在标准指纹图谱库中检索,如果待测品种的带型与标准库中的某一带型相同,则认定待测品种与标准库中的某一品种相同;如果未检索到相同带型,则进行下步操作;④、分析rbm36、rbm24和rbm55引物组合在待测品种中的带型,并在标准指纹图谱库中检索,如果待测品种的带型与标准库中的某一带型相同,则认定待测品种与标准库中的某一品种相同;如果未检索到相同带型,则进行下步操作;⑤、分析rbm36、rbm24、rbm55和rbm50引物组合在待测品种中的带型,并在标准指纹图谱库中检索,如果待测品种的带型与标准库中的某一带型相同,则认定待测品种与标准库中的某一品种相同;如果未检索到相同带型,则进行下步操作;⑥、分析rbm36、rbm24、rbm55、rbm50和rbm73引物组合在待测品种中的带型,并在标准指纹图谱库中检索,如果待测品种的带型与标准库中的某一带型相同,则认为待测品种与标准库中的某一品种相同;如果未检索到相同带型,则认定待测品种为新品种,可将其带型收入标准指纹图谱库中。
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