发明名称 用于比对大分子中的结合位点容积的系统和方法
摘要 本发明提供了用于评价大分子的结合位点的系统、方法和设备,其中该结合位点被识别且该结合位点的结合位点容积图被构建。该结合位点容积图具有含多个区域的表面。将该表面的多个区域中的每个单独区域基于第一特征进行分类,该第一特征与该大分子的与该单独区域最接近的部分的第二特征互补,从而产生相互作用图。本发明还提供了比较大分子的方法、系统和设备,其中为每个所述大分子构建结合位点容积图。然后,构建包含每个所述结合位点容积图的容积组合的复合结合位点容积图。从该复合结合位点容积图可以构建相互作用图。
申请公布号 CN101470776A 申请公布日期 2009.07.01
申请号 CN200810126151.6 申请日期 2008.06.27
申请人 弗·哈夫曼-拉罗切有限公司;化学计算集团公司 发明人 尼迪·阿洛拉;克里斯·威廉斯
分类号 G06F19/00(2006.01)I 主分类号 G06F19/00(2006.01)I
代理机构 北京安信方达知识产权代理有限公司 代理人 陶贻丰;郑 霞
主权项 1. 评价大分子结合位点的方法,该方法包括:(A). 识别所述大分子的结合位点,其中该结合位点由多个残基排列形成,且其中该结合位点没有结合配体;(B). 确定所述结合位点的结合位点容积图,其中该结合位点容积图包含具有多个区域的表面;和(C). 将所述结合位点容积图的所述表面的多个区域的各个单独区域基于第一特征进行分类,该第一特征与该大分子的与该单独区域最接近的部分的第二特征互补,从而产生相互作用图。
地址 瑞士巴塞尔