鱼类种质资源遗传分析装置

摘要

鱼类种质资源遗传分析装置，涉及到分子生物学DNA分子标记数据分析技术领域。它解决了现有鱼类种质资源遗传分析过程中，需要根据使用功能软件的要求人工转换分子标记数据格式及分别调用各种功能软件的问题。本发明将现有多个分子标记分析软件集成到一起，通过建立工程文件实现多个分析软件联合使用的目的，通过格式转换装置使原本使用多种格式文件的多个分析软件能够采用一种格式的输入文件实现多种分析、获得多种分析结果的目的。本发明可以作为群体遗传多样性及遗传结构等方面研究的一个基本工具，推广应用到濒危鱼类保护、野生资源评估、养殖鱼类遗传指导、鱼类遗传育种等领域。

主权项

1、鱼类种质资源遗传分析装置，其特征在于它由以下部分组成：用于将指定的由分子标记检测获得的电泳图谱转换成0，1矩阵的Excel格式的分子标记文件的数据输入装置；用于设置数据分析处理步骤及各步骤的处理参数形成工程文件，进而为调用装置提供工作顺序流程的工程建立装置；用于将数据输入装置获得的0，1矩阵的Excel格式的分子标记文件转换成分析装置中各个分析软件模块需要的输入格式文件的格式转换装置；用于根据工程建立装置形成的工程文件调用分析装置中的分析软件模块的调用装置；用于对分子标记数据进行分析的分析装置；其中所述数据分析装置包括：用于完成哈代温博格平衡、群体分化、连锁不平衡、基因流参数分析的Genepop软件模块；用于对基因频率、基因型频率、等位基因数目、杂合度、群体自交系数及遗传分化、基因流参数进行分析的PopGene软件模块；用于处理包括核酸序列、分子标记数据、包括形态学数据在类的离散或连续分布的数据，完成鱼类种质资源的群体或品种演化相关分析的Phylip系列软件模块；用于完成鱼类种质资源遗传群体的确定及群体、个体的亲缘分配，获得群体迁徙路线、群体分化程度、群体演化等结果分析的Structure软件模块。