一类新型EPSP合酶的鉴定

摘要

提供了用于赋予细菌、植物、植物细胞、组织和种子草甘膦耐受性的组合物和方法。所述组合物包含一类称为III型的新型EPSPS酶，和编码该酶的多核苷酸、含有那些多核苷酸的载体，以及含有该载体的宿主细胞。这种新的蛋白质含有至少一个选自在此提供的III型结构域的序列结构域。这些序列结构域可用来鉴定具有抗草甘膦活性的EPSP合酶。

主权项

1.一种不同于在SEQ ID NO：1、3、7、45、47和53中列出的多核苷酸序列的分离的多核苷酸，所述的分离的多核苷酸编码具有至少一个选自以下的序列结构域的EPSPS酶：结构域I：L-A-K-G-X1-S-X2-L-X3-G-A-L-K-S-D-D-T(SEQ ID NO：13)，其中X1表示赖氨酸或苏氨酸，其中X2表示精氨酸或组氨酸，其中X3表示丝氨酸或苏氨酸；结构域Ia：L-A-K-G-X1(SEQ ID No：14)，其中X1表示赖氨酸或苏氨酸；结构域Ib：S-X1-L-X2(SEQ ID NO：15)，其中X1表示精氨酸或组氨酸，其中X2 表示丝氨酸或苏氨酸；结构域Ic：G-A-L-K-S-D-D-T(SEQ ID NO：16)；结构域II：E-P-D-X1-X2-T-F-X3-V-X4-X5-X6-G(SEQ ID NO：17)，其中X1表示天冬氨酸或丙氨酸，其中X2表示丝氨酸或苏氨酸，其中X3表示缬氨酸或异亮氨酸，其中X4表示苏氨酸或谷氨酸或赖氨酸，其中X5表示丝氨酸或甘氨酸，其中X6表示谷氨酰胺或丝氨酸或谷氨酸或苏氨酸；结构域IIa：E-P-D-X1-X2-T-F-X3-V(SEQ ID NO：18)，其中X1表示天冬氨酸或丙氨酸，其中X2表示丝氨酸或苏氨酸，其中X3表示缬氨酸或异亮氨酸；结构域IIb：X1-X2-X3-G(SEQ ID NO：19)，其中X1表示苏氨酸或谷氨酸或赖氨酸，其中X2表示丝氨酸或甘氨酸，其中X3表示谷氨酰胺或丝氨酸或谷氨酸或苏氨酸；结构域III：RFLTAA(SEQ ID NO：20)；结构域IV：KRPI(G/M)P(SEQ ID NO：21)K-R-P-I-X1-P，其中X1表示甘氨酸或甲硫氨酸或亮氨酸；结构域V：X1-G-C-P-P-V(SEQ ID NO：22)，其中X1表示苏氨酸或丝氨酸；结构域VI：I-G-A-X1-G-Y-X2-D-L-T(SEQ ID NO：23)，其中X1表示精氨酸或赖氨酸或亮氨酸，并且其中X2表示异亮氨酸或缬氨酸；结构域VII：W-X1-V-X2-X3-T-G(SEQ ID NO：24)，其中X1表示精氨酸或赖氨酸，其中X2表示丙氨酸或组氨酸或谷氨酸或丝氨酸，其中X3表示脯氨酸或丙氨酸；结构域VIII：E-P-D-A-S-A-A-T-Y-L-W-X1-A-X2-X3-L(SEQ ID NO：25)，其中X1 表示丙氨酸或甘氨酸，其中X2表示谷氨酸或谷氨酰胺，其中X3表示缬氨酸或亮氨酸或丙氨酸；结构域VIIIa：E-P-D-A-S-A-A-T-Y-L-W(SEQ ID NO：26)；结构域IX：I-D-X1-G(SEQ ID NO：27)，其中X1表示异亮氨酸或亮氨酸；结构域X：F-X1-Q-P-D-A-K-A(SEQ ID NO：28)，其中X1表示苏氨酸或丝氨酸；结构域XI：X1-F-P-X2-X3-X4-A-X5-X6-X7-G-S-Q-M-Q-D-A-I-P-T-X8-A-V-X9A-A-F-N(SEQ ID NO：29)，其中X1表示谷氨酰胺或赖氨酸或丝氨酸，其中X2表示天冬酰胺或组氨酸，其中X3表示甲硫氨酸或亮氨酸，其中X4表示脯氨酸或谷氨酰胺，其中X5表示苏氨酸或谷氨酸或缬氨酸，其中X6 表示缬氨酸或异亮氨酸，其中X7表示天冬氨酸或缬氨酸，其中X8表示亮氨酸或异亮氨酸，其中X9表示亮氨酸或异亮氨酸；结构域XIa：X1-F-P-X2-X3-X4-A(SEQ ID NO：30)，其中X1表示谷氨酰胺或赖氨酸或丝氨酸，其中X2表示天冬酰胺或组氨酸，其中X3表示甲硫氨酸或亮氨酸，其中X4表示脯氨酸或谷氨酰胺；结构域XIb：X1-X2-X3-G-S-Q-M-Q-D-A-I-P-T-X4-A-V-X5A-A-F-N(SEQ IDNO：31)，其中X1表示苏氨酸或谷氨酸或缬氨酸，其中X2表示缬氨酸或异亮氨酸，其中X3表示天冬氨酸或缬氨酸，其中X4表示亮氨酸或异亮氨酸，其中X5表示亮氨酸或异亮氨酸；结构域XIc：G-S-Q-M-Q-D-A-I-P-T(SEQ ID NO：32)；结构域XII：P-V-R-F-X1-X2-X3-X4-N-L-R-V-K-E-C-D-R-X5(SEQ ID NO：33)，其中X1表示缬氨酸或苏氨酸，其中X2表示谷氨酸或甘氨酸，其中X3表示亮氨酸或异亮氨酸，其中X4表示丙氨酸或谷氨酸，其中X5表示异亮氨酸或缬氨酸；结构域XIIa：P-V-R-F(SEQ ID NO：34)；结构域XIIb：X1-X2-X3-X4-N-L-R-V-K-E-C-D-R-X5(SEQ ID NO：35)，其中X1表示缬氨酸或苏氨酸，其中X2表示谷氨酸或甘氨酸，其中X3表示亮氨酸或异亮氨酸，其中X4表示丙氨酸或谷氨酸，其中X5表示异亮氨酸或缬氨酸；结构域XIIc：N-L-R-V-K-E-C-D-R(SEQ ID NO：36)；结构域XIII：E-G-D-D-L-X1-X2(SEQ ID NO：37)，其中X1表示亮氨酸或异亮氨酸，其中X2表示缬氨酸或异亮氨酸；结构域XIV：X1-P-X2-L-A-G(SEQ ID NO：38)，其中X1表示天冬氨酸或天冬酰胺，其中X2表示丙氨酸或丝氨酸或苏氨酸；结构域XV：A-X1-I-D-X2-X3-X4-D-H-R(SEQ ID NO：39)，其中X1表示亮氨酸或丝氨酸或谷氨酸，其中X2表示苏氨酸或丝氨酸，其中X3表示组氨酸或苯丙氨酸，其中X4表示丙氨酸或丝氨酸；结构域XVI：F-A-L-A-X1-L-K-X2-X3-G-I(SEQ ID NO：40)，其中X1表示甘氨酸或丙氨酸，其中X2表示异亮氨酸或缬氨酸，其中X3表示丝氨酸或甘氨酸或丙氨酸或赖氨酸；结构域XVIa：F-A-L-A-X1-L-K(SEQ ID NO：41)，其中X1表示甘氨酸或丙氨酸；结构域XVIb：L-K-X1-X2-G-I(SEQ ID NO：42)，其中X1表示异亮氨酸或缬氨酸，其中X2表示丝氨酸或甘氨酸或丙氨酸或赖氨酸；结构域XVII：-X1-P-X2-C-V-X3-K(SEQ ID NO：43)，其中X1表示天冬酰胺或天冬氨酸，其中X2表示丙氨酸或天冬氨酸，其中X3表示丙氨酸或甘氨酸；结构域XVIII：X1-S-L-G-V(SEQ ID NO：44)，其中X1表示丙氨酸或丝氨酸或脯氨酸。