发明名称 对肝脏疾病治疗的反应性
摘要 用于预测受试者对于肝脏疾病治疗的反应性的核酸群及其方法。
申请公布号 TWI295324 申请公布日期 2008.04.01
申请号 TW093134793 申请日期 2004.11.12
申请人 赛亚基因科技股份有限公司 发明人 黄渝棋;陈广典;张景薇;陈瑞麟;陈定信;陈培哲;赖明阳
分类号 C12Q1/68(2006.01) 主分类号 C12Q1/68(2006.01)
代理机构 代理人 黄重智 新竹市四维路130号13楼之7
主权项 1.一种评估患有C型肝炎之中国台湾人对INF-/ribavirin 的反应性的方法,包括下列步骤: 提供该患有C型肝炎之中国台湾人的核酸样本; 判断包含以下数种或其中之一之人类ADAR、CASP5、 FGF1、ICSBP1、IFI44、PIK3CG、TAP2、以及TGFBRAP1基因群 的单一核酸多型性基因型;以及 将该单一核酸多型性基因型与一已先判定的单 一核酸多型性基因型作比较,如果该患有C型肝 炎之中国台湾人的该单一核酸多型性基因型与该已 先判定的单一核酸多型性基因型相同,则该患有 C型肝炎之中国台湾人被预期对该INF-/ribavirin是具有 反应性或不具反应性。 2.如申请专利范围第1项之方法,其中该核酸样本包 括以下数种或其中之一的: 一第一目标核酸,从人类ADAR基因核酸模版,以每个 都包含一选自ADAR基因区域的寡核酸的第一对引 子增殖得到; 一第二目标核酸,从人类CASP5基因核酸模版,以每个 都包含一选自CASP5基因区域的寡核酸的第二对 引子增殖得到; 一第三目标核酸,从人类FGF1基因核酸模版,以每个 都包含一选自FGF1基因区域的寡核酸的第三对引 子增殖得到; 一第四目标核酸,从人类ICSBP1基因核酸模版,以每 个都包含一选自ICSBP1基因区域的寡核酸的第四 对引子增殖得到; 一第五目标核酸,从人类IFI44基因核酸模版,以每个 都包含一选自IFI44基因区域的寡核酸的第五对 引子增殖得到; 一第六目标核酸,从人类PIK3CG基因核酸模版,以每 个都包含一选自PIK3CG基因区域的寡核酸的第六 对引子增殖得到; 一第七目标核酸,从人类TAP2基因核酸模版,以每个 都包含一选自TAP2基因区域的寡核酸的第七对引 子增殖得到;以及 一第八目标核酸,从人类TGFBRAP1基因核酸模版,以每 个都包含一选自TGFBRAP1基因区域的寡核酸的第 八对引子增殖得到; 其中,每个目标基因核酸都有一个核酸在一个单 一核酸多型性位置上,而且其长度是20到1000个核 酸。 3.如申请专利范围第2项之方法,其中, 该第一目标核酸包括SEQ ID NO:2; 该第二目标核酸包括SEQ ID NO:7; 该第三目标核酸包括SEQ ID NO:14; 该第四目标核酸包括SEQ ID NO:26; 该第五目标核酸包括SEQ ID NO:32; 该第六目标核酸包括SEQ ID NO:42; 该第七目标核酸包括SEQ ID NO:46;以及 该第八目标核酸包括SEQ ID NO:56。 4.如申请专利范围第2项之方法,其中, 在该第一对引子的寡核酸是SEQ ID NOs:77和78; 在该第二对引子的寡核酸是SEQ ID NOs:81和82; 在该第三对引子的寡核酸是SEQ ID NOs:95和96; 在该第四对引子的寡核酸是SEQ ID NOs:101和102; 在该第五对引子的寡核酸是SEQ ID NOs:113和114; 在该第六对引子的寡核酸是SEQ ID NOs:127和128; 在该第七对引子的寡核酸是SEQ ID NOs:135和136;以 及 在该第八对引子的寡核酸是SEQ ID NOs:151和152。 5.一种评估患有C型肝炎之中国台湾人对INF-/ribavirin 的反应性的方法,包括下列步骤: 提供该患有C型肝炎之中国台湾人的核酸样本; 判断包含人类ADAR、CASP5、FGF1、ICSBP1、IFI44、PIK3CG 、TAP2以及TGFBRAP1基因的基因群的单一核酸多型 性基因型;以及 将该人类ADAR、CASP5、FGF1、ICSBP1、IFI44、PIK3CG、TAP2 以及TGFBRAP1基因的单一核酸多型性基因型与一 已先判定的每一人类ADAR、CASP5、FGF1、ICSBP1、IFI44 、PIK3CG、TAP2以及TGFBRAP1基因的单一核酸多型性 基因型作比较,如果该患有C型肝炎之谈湾人的该 单一核酸多型性基因型与该已先判定的人类ADAR 、CASP5、FGF1、ICSBP1、IFI44、PIK3CG、TAP2以及TGFBRAP1 基因的单一核酸多型性基因型相同,则该患有C 型肝炎之中国台湾人被预期对该INF-/ribavirin是具有 反应性或不具反应性。 6.如申请专利范围第5项之方法,其中该核酸样本包 括: 一第一目标核酸,从人类ADAR基因核酸模版,以每个 都包含一选自ADAR基因区域的寡核酸的第一对引 子增殖得到; 一第二目标核酸,从人类CASP5基因核酸模版,以每个 都包含一选自CASP5基因区域的寡核酸的第二对 引子增殖得到; 一第三目标核酸,从人类FGF1基因核酸模版,以每个 都包含一选自FGF1基因区域的寡核酸的第三对引 子增殖得到; 一第四目标核酸,从人类ICSBP1基因核酸模版,以每 个都包含一选自ICSBP1基因区域的寡核酸的第四 对引子增殖得到; 一第五目标核酸,从人类IFI44基因核酸模版,以每个 都包含一选自IFI44基因区域的寡核酸的第五对 引子增殖得到; 一第六目标核酸,从人类PIK3CG基因核酸模版,以每 个都包含一选自PIK3CG基因区域的寡核酸的第六 对引子增殖得到; 一第七目标核酸,从人类TAP2基因核酸模版,以每个 都包含一选自TAP2基因区域的寡核酸的第七对引 子增殖得到;以及 一第八目标核酸,从人类TGFBRAP1基因核酸模版,以每 个都包含一选自TGFBRAP1基因区域的寡核酸的第 八对引子增殖得到; 其中,每个目标基因核酸都有一个核酸在一个单 一核酸多型性位置上,而且其长度是20到1000个核 酸。 7.如申请专利范围第6项之方法,其中, 该第一目标核酸包括SEQ ID NO:1、2、3、4、5或6; 该第二目标核酸包括SEQ ID NO:7、8、9、10、11、12或 13; 该第三目标核酸包括SEQ ID NO:14、15、16、17、18、19 、20、21或22; 该第四目标核酸包括SEQ ID NO:23、24、25、26、27、28 、29或30; 该第五目标核酸包括SEQ ID NO:31、32、33、34、35、36 、37、38、39或40; 该第六目标核酸包括SEQ ID NO:41、42、43或44; 该第七目标核酸包括SEQ ID N0:45、46、47、48、49、50 、51或52;以及 该第八目标核酸包括SEQ ID NO:53、54、55、56、57、58 、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、 71、72、73或74。 8.如申请专利范围第7项之方法,其中, 该第一目标核酸包括SEQ ID NO:2; 该第二目标核酸包括SEQ ID NO:7; 该第三目标核酸包括SEQ ID NO:14; 该第四目标核酸包括SEQ ID NO:26; 该第五目标核酸包括SEQ ID NO:32; 该第六目标核酸包括SEQ ID NO:42; 该第七目标核酸包括SEQ ID NO:46;以及 该第八目标核酸包括SEQ ID NO:56。
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