一种检测和鉴定分枝杆菌菌种的方法及其专用试剂盒

摘要

本发明公开了一种检测和鉴定分枝杆菌菌种的方法及其专用试剂盒。该分枝杆菌菌种检测及鉴定试剂盒，包括分枝杆菌属特异引物和分枝杆菌菌种检测芯片；所述分枝杆菌菌种检测芯片包括分枝杆菌菌种检测探针；所述分枝杆菌菌种检测探针由分枝杆菌属特异探针，结核分枝杆菌复合群特异探针和27个分枝杆菌种特异探针组成。本发明所提供的利用上述试剂盒检测分枝杆菌的方法，是以待测分枝杆菌样品的基因组DNA为模板，利用所述分枝杆菌属特异引物进行PCR扩增，将得到的PCR扩增产物与所述分枝杆菌菌种检测芯片进行杂交，根据杂交信号判定待测分枝杆菌。

主权项

1、分枝杆菌菌种检测及鉴定试剂盒，包括分枝杆菌属特异引物和分枝杆菌菌种检测芯片；所述分枝杆菌菌种检测芯片包括分枝杆菌菌种检测探针；所述分枝杆菌菌种检测探针由分枝杆菌属特异探针，结核分枝杆菌复合群特异探针和以下27种分枝杆菌种特异探针组成：堪萨斯分枝杆菌、海-溃疡分枝杆菌、猿猴分枝杆菌、瘰疬分枝杆菌、戈登分枝杆菌、苏加分枝杆菌、鸟分枝杆菌、胞内分枝杆菌、蟾蜍-施氏分枝杆菌、马尔摩分枝杆菌、土地分枝杆菌、不产色分枝杆菌、胃分支杆菌、次要分枝杆菌、亚洲分枝杆菌、施氏分枝杆菌、偶然分枝杆菌、龟分枝杆菌、脓肿分枝杆菌、耻垢分枝杆菌、草分枝杆菌、淡黄分枝杆菌、浅黄分枝杆菌、迪氏分枝杆菌、母牛分枝杆菌、金色-迪氏-楚布分枝杆菌、新金色分枝杆菌特异探针；所述分枝杆菌属特异引物为具有序列表中序列1和序列2的核苷酸序列的两个寡核苷酸；所述分枝杆菌属特异探针是至少具有序列表中序列3的核苷酸序列的寡核苷酸；所述结核分枝杆菌复合群特异探针是至少具有序列表中序列5和/或序列7的核苷酸序列的寡核苷酸；所述堪萨斯分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列9和/或序列10的核苷酸序列的寡核苷酸；所述海-溃疡分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列12的核苷酸序列的寡核苷酸；所述猿猴分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列14和/或序列16的核苷酸序列的寡核苷酸；所述瘰疬分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列18的核苷酸序列的寡核苷酸；所述戈登分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列20的核苷酸序列的寡核苷酸；所述苏加分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列22的核苷酸序列的寡核苷酸；所述鸟分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列24的核苷酸序列的寡核苷酸；所述胞内分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列26的核苷酸序列的寡核苷酸；所述蟾蜍-施氏分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列28和/或序列30的核苷酸序列的寡核苷酸；所述马尔摩分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列32的核苷酸序列的寡核苷酸；所述土地分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列34的核苷酸序列的寡核苷酸；所述不产色分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列36的核苷酸序列的寡核苷酸；所述胃分支杆菌特异探针是至少具有序列表中序列38的核苷酸序列的寡核苷酸；所述次要分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列40的核苷酸序列的寡核苷酸；所述亚洲分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列42的核苷酸序列的寡核苷酸；所述施氏分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列44的核苷酸序列的寡核苷酸；所述偶然分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列46的核苷酸序列的寡核苷酸；所述龟分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列48和/或序列50的核苷酸序列的寡核苷酸；所述脓肿分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列52的核苷酸序列的寡核苷酸；所述耻垢分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列54的核苷酸序列的寡核苷酸；所述草分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列56的核苷酸序列的寡核苷酸；所述淡黄分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列58的核苷酸序列的寡核苷酸；所述浅黄分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列60的核苷酸序列的寡核苷酸；所述迪氏分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列62的核苷酸序列的寡核苷酸；所述母牛分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列64的核苷酸序列的寡核苷酸；所述金色-迪氏-楚布分枝杆菌特异探针是至少具有序列表中序列66的核苷酸序列的寡核苷酸；所述新金色分枝杆菌是至少具有序列表中序列68和/或序列70和/或序列72的核苷酸序列的寡核苷酸。