检测STRP例如脆性X染色体综合征

摘要

提供了检测短串联重复多态性(STRP)如脆性X染色体综合征的方法，其中采用PCR扩增基因组DNA染色体中的核酸，扩增的核酸包括所有感兴趣的STR以及毗邻STR的核酸的基本邻接的片段。然后获得了单链产物，将靶向(i)STR和(ii)邻接的DNA片段的荧光标记的寡核苷酸与所述单链产物杂交，然后结合于固相并与剩余的靶向物分开。用碱处理回收标记的寡核苷酸靶向物，然后与含有多个斑点的微阵列杂交，所述斑点中含有与所述寡核苷酸靶向物互补的合适的寡核苷酸探针。杂交后，检测微阵列上具体斑点中存在的标记的杂交靶的荧光强度以获得各值，并与已知对照样品的结果比较，以准确定量被分析DNA感兴趣区域的STR数目。

主权项

1.一种检测脆性X染色体综合征突变指征的方法，该方法包括以下步骤：(a)获得要检测的基因组DNA，(b)用PCR沿基因组DNA中X染色体扩增核酸，该核酸包括FRAXA基因非翻译部分的所有CGG重复和与所述CGG重复毗邻的核酸的基本邻接区段，(c)从步骤(b)扩增的核酸获得单链产物，(d)将靶向(i)(CGG)重复和(ii)所述邻接核酸区段的比色标记的寡核苷酸与步骤(c)中所述的单链产物杂交，(e)将步骤(c)中所述的单链产物结合于固相，(f)将步骤(d)所述杂交产物与剩余的靶物质分离，(g)从步骤(f)分离的产物中回收标记的靶物质，(h)然后将步骤(g)中回收的标记的靶物质与微阵列杂交，该微阵列具有多个含有合适的与所述靶物质互补的寡核苷酸探针的斑点，(i)与微阵列杂交后，检测微阵列上具体斑点中杂交的标记靶物质的比色强度，以获得各自的数值，和(j)将步骤(i)中的结果与已知对照样品的结果比较，以准确定量获得的基因组DNA中FRAXA基因的CGG重复数目。