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Un método para detectar la presencia o ausencia del virus de la viruela en una muestra biológica de un individuo, que comprende: realizar al menos una etapa de ciclación, donde una etapa de ciclación comprende una etapa de amplificación y una etapa de hibridación, donde dicha etapa de amplificación comprende poner dicha muestra en contacto con un par de cebadores de hemaglutinina (HA) para producir un producto de amplificación de HA si una molécula de ácido nucleico de HA del virus de la viruela está presente en dicha muestra, donde dicha etapa de hibridación comprende poner dicha muestra en contacto con un par de muestras de HA, donde los elementos de dicho par de muestras de HA forman híbridos con no más de cinco nucleótidos de cada uno, donde una primera muestra de HA de dicho par de muestras de HA se etiqueta con una mitad fluorescente donante y dicha segunda muestra de HA de dicho par de muestras de HA se etiqueta con una mitad fluorescente del aceptor correspondiente; y detectar la presencia o ausencia de la transferencia de energía por resonancia de fluorescencia (FRET) entre dicha mitad fluorescente del donante y dicha primera muestra de HA y dicha mitad fluorescente del aceptor y dicha segunda muestra de HA. donde la presencia de FRET es indicativa de la presencia del virus de la viruela en dicha muestra biológica, y donde la ausencia del FRET es indicativa de la ausencia del virus de la viruela en dicha muestra biológica, que además comprende las etapas de realizar al menos una etapa de ciclación, donde dicha etapa de ciclación comprende una etapa de amplificación y una etapa de hibridación, producir un producto de amplificación TK si una molécula de ácido nucleico de TK del virus de la viruela está presente en dicha muestra, donde dicha etapa de hibridación comprende poner dicha muestra en contacto con un par de muestras de TK, donde los elementos de dicho par de muestras de TK forman híbridos con no más de cinco nucleótidos de cada uno, donde una primera muestra de TK de dicho par de muestras de TK se etiqueta con una mitad fluorescente donante y dicha segunda muestra de TK de dicho par de muestras de TK se etiqueta con una mitad fluorescente aceptor correspondiente; y detectar la presencia o ausencia de FRET entre dicha mitad fluorescente donante de dicha primera muestra de TK y dicha mitad fluorescente aceptor de dicha segunda muestra de TK.
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