生物基因组可视化的希尔伯特—皮亚诺曲线法

摘要

本发明提出了一种生物基因组可视化方法。以DNA(RNA)序列的一维长链为基础，其特征在于：给基因组序列中的每个碱基位置按其局部特征赋予一种颜色，并将色彩丰富的基因序列长链上的全部碱基按希尔伯特—皮亚诺法则映射至一个紧致平面图形内，转化为希尔伯特—正方形，映射时从其左上角顶点开始，每一个点只通过一次。所说的每个碱基位置按其局部特征赋予一个颜色，是将每个碱基位置的四种碱基的丰度构成一个四元组并赋值给该位置，然后再将该四元组变换为一个由红、绿、蓝生成的颜色。采用本发明的方法能很好的解决基因组可视化时其解像力与总体印象之间的矛盾，并且能够很直观地反映出各种基因组的特征。

主权项

1.一种生物基因组可视化方法，以DNA(RNA)序列的一维长链为基础，其特征在于：给基因组序列中的每个碱基位置按其局部特征赋予一种颜色，并将色彩丰富的基因序列长链上的全部碱基按希尔伯特—皮亚诺法则映射至一个紧致平面图形内，转化为基因组的希尔伯特—皮亚诺曲线。