检测序列差异的方法

摘要

本发明涉及分析核酸样品中单核苷酸差异基因型的方法。更具体地说，本发明提供了鉴别基因组DNA样品中多态性位点或多态性位点组处的核苷酸的方法。该方法使用标签引物延伸，其中一组标签序列对应于多态性位点处的核苷酸。引物延伸产物使用通用的一组标签特异性引物进行PCR扩增，其中下游引物带有可区分标记物。根据大小和/或电荷分离后，在预期大小的产物中检测可区分标记物可以确定多态性位点处的核苷酸。该方法非常适于分析一系列反应物中多处单核苷酸差异的基因型。

主权项

1.一种鉴别给定核酸样品中已知多态性位点处的核苷酸的方法，该方法包括：a)使从核酸样品产生的引物延伸产物群经历扩增过程，每个引物延伸产物包含一个标签序列，所述标签序列特异对应于已知多态性位点处一个特定核苷酸的存在，其中所述扩增过程使用一个上游扩增引物和一组可区分标记的下游扩增引物进行，所述下游扩增引物组的每个成员包含所述引物延伸产物群成员所带有的所述标签序列和可区分标记物，其中每种可区分标记物特异对应于所述多态性位点处特定核苷酸的存在；和b)检测可区分标记物向核酸分子中的掺入，从而鉴别所述多态性位点处的核苷酸。