新的丙型肝炎病毒基因型及其作为预防剂、治疗剂和诊断剂的用途

摘要

本发明涉及相当于新型HCV的非编码区和编码区的基因组核苷酸序列和氨基酸序列。本发明涉及不同于已知HCV类型和亚型序列的新的HCV类型和亚型序列。具体地讲，本发明涉及所述新的HCV类型序列；用于制备所述序列的方法，及其在诊断、预防和治疗上的用途。更具体地讲，本发明提供了新的HCV类型的5′NCR，核心，E1和NS5区的新的类型特异性序列。所述新的HCV序列可用于诊断生物学样品中HCV类型基因型或血清型的存在。另外，所述新的类型特异性序列的可利用性，能够提高HCV检测的总体灵敏度，并且还被证实可用于预防和治疗目的。

主权项

1.一种具有不同于进化枝6HCV基因型6-9和11的基因型的进化枝6 HCV病毒的分离的HCV多核酸，所述多核酸的特征在于，它包括选自下面任意一种的核酸序列：-由SEQI D NOs：1，2，4，6，8，10，12，14，36-47或49中任意一种所限定的核酸序列；-包括相对于HCV多蛋白编码序列的起始密码子而言，位于-159号位置上的腺嘌呤核苷酸的5’UTR核酸序列-与SEQ ID NOs：39-41中任意一种的同一性至少为89％的核心核酸序列；-与SEQ ID NO：42的同一性至少为71％的E1核酸序列；-与SEQ ID NOs：10，12，14中任意一种的同一性至少为78％的核心/E1核酸序列；-与SEQ ID NOs：36-38中任意一种的同一性至少为84％的核心/E1核酸序列；-与SEQ ID NO：8的同一性至少为75％的NS5B核酸序列；-编码由SEQ ID NOs：3，5，7，9，11，13，15，50-61或63中任意一种所限定的HCV多蛋白片段的核酸序列；-编码与SEQ ID NO：53-55中任意一种的同一性至少为92％的核心蛋白片段的核酸序列；-编码与SEQ ID NO：56的同一性至少为79％的E1蛋白片段的核酸序列；-编码与SEQ ID NOs：11，13，15中任意一种的同一性至少为85％的核心/E1蛋白片段的核酸序列；-编码与SEQ ID NOs：50-52中任意一种的同一性至少为91％的核心/E1蛋白片段的核酸序列；-编码与SEQ ID NO：9的同一性至少为87％的NS5B蛋白片段的核酸序列；为所述HCV基因组所特有的上述任意一种核酸序列的片段；或为所述HCV基因型所特有的所述任意一种核酸序列或所述任意一种核酸序列的片段的互补体。