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Der Reader umfasst ein Bündel von Lichtwellenleitern, die zu einem Lichtleiterblock verbunden sind und derart mit einer Lichtquelle kombiniert sind, dass das von dieser Lichtquelle emittierte Licht in jeden Lichtwellenleiter einkoppelbar und in diesem zum Biochip leitbar ist, um dort vorhandene Fluoreszenzfarbstoffe zur Aussendung von Fluoreszenzlichtsignalen anzuregen. Jeder Lichtwellenleiter ist außerdem dazu geeignet, Fluoreszenzlichtsignale auf dem Biochip aufzunehmen und zu einem Detektor zu leiten, der dieses Signal erfasst. Die Lichtwellenleiter sind an ihrem einen Ende mit einer optischen Sende- und Empfangseinheit gekoppelt, deren Sendeelement mit der Lichtquelle verbunden ist, und deren Empfangselement mit dem optischen Detektor gekoppelt ist. An ihrem anderen Ende sind die Lichtwellenleiter derart in den Lichtleiterblock eingebettet, dass die Stirnflächen frei zugänglich sind. Die Sende- und Empfangseinheiten sind mit einer Steuerung gekoppelt, die zu ihrer Aktivierung und Deaktivierung geeignet ist.
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