表皮葡萄球菌色氨酰－tRNA合成酶及其在筛选药物中的应用

摘要

本发明属生物技术领域，具体涉及表皮葡萄球菌色氨酰－tRNA合成酶(TrpRS)和色氨酸专职tRNA(tRNA^trp)。本发明将TrpRS的基因克隆入原核表达载体，表达出相应蛋白，并对其进行纯化和功能测定。此外，还对TrpRS蛋白结构进行三维模建，对tRNA^trp进行了体外转录。本发明还利用TrpRS蛋白与tRNA^trp和ATP分的相互作用筛选药物化合物，并在细胞和蛋白水平对筛选出的化合物的作用进行了研究，确证其可以抑制TrpRS蛋白与tRNA^trp以及ATP的结合。

主权项

1.表皮葡萄球菌色氨酰-tRNA合成酶，其特征是其保守区包括从N末端起第15-18个氨基酸(TIGN)以及第193-197个氨基酸(KMSKS)的两个区域，还包括TrpRS蛋白与tRNAtrp结合的位点：N末端起第107-122个氨基酸(QFKDKAQKRADGVPAG)以及第234-238个氨基酸(ENKPG)，所述合成酶通过序列同源性比较及功能域分析等生物信息学手段在表皮葡萄球菌ATCC12228株全基因组序列(GeneBank收录号AE015929)中选择色氨酰-tRNA合成酶的基因SEQUENCE 2和蛋白SEQUENCE 1以及tRNAtrp基因SEQUENCE 3。