诺丝七肽的生物合成基因簇

摘要

本发明涉及诺丝七肽的生物合成基因簇，具体说是一种由链霉菌产生的具有抗革兰氏阳性菌抗生素—诺丝七肽(Nosiheptide)的生物合成基因簇的克隆、测序、分析、功能研究及其应用。整个基因簇共包含16个基因：6个与Nosiheptide大环生物合成相关基因，5个与侧链生物合成相关基因，4个与翻译后修饰相关基因，1个调控基因。通过对上述生物合成基因的遗传操作可阻断诺丝七肽的合成。本发明所提供的基因及其蛋白也可以用来寻找和发现可用于医药、工业或农业的化合物或基因、蛋白。

主权项

1.一种抗革兰氏阳性菌活性的抗生素-诺丝七肽的生物合成基因簇，其特征在于编码诺丝七肽生物合成所涉及的16个基因，具体为：1)1个功能未知蛋白基因，即nosA：nosA位于基因簇核苷酸序列第2704-2249个碱基处，长度为456个碱基对，编码一个功能未知蛋白，151个氨基酸；2)细胞色素P450氧化酶基因，即nosB：nosB位于基因簇核苷酸序列第4068-2701个碱基处，长度为1368个碱基对，编码细胞色素P450氧化酶，455个氨基酸；3)类P450氧化酶基因，即nosC：nosC位于基因簇核苷酸序列第5309-4083个碱基处，长度为1227个碱基对，编码P450氧化酶，408个氨基酸；4)脱水酶基因，即nosD：nosD位于基因簇核苷酸序列第个6365-5328碱基处，长度为1038个碱基对，编码脱水酶，345个氨基酸；5)脱水酶基因，即nosE：nosE位于基因簇核苷酸序列第个9114-6352碱基处，长度为2763个碱基对，编码脱水酶，920个氨基酸；6)NADH依赖的脱氢酶基因，即nosF：NosF位于基因簇核苷酸序列第10778-9129个碱基处，长度为1650个碱基对，编码甲基基转移酶，549个氨基酸；7)与Nosiheptide主链生物合成相关但具体功能未知的基因，即nosG：nosG位于基因簇核苷酸序列第12800-10830个碱基处，长度为1971个碱基对，编码一个未知功能蛋白，656个氨基酸；8)与Nosiheptide主链生物合成相关但具体功能未知的基因，即nosH：nosH位于基因簇核苷酸序列第14761-12797个碱基处，长度为654个碱基对，编码一个未知功能蛋白，654个氨基酸；9)乙酰辅酶A合成酶基因，即nosI：nosI位于基因簇核苷酸序列第16097-14763个碱基处，长度为1335个碱基对，编码乙酰辅酶A合成酶，444个氨基酸；10)与Nosiheptide侧链生物合成相关但具体功能未知的基因，即nosJ：nosJ位于基因簇核苷酸序列第16297-16058个碱基处，长度为240个碱基对，编码一个未知功能蛋白，79个氨基酸；11)水解酶基因，即nosK：nosK位于基因簇核苷酸序列第17106-16294个碱基处，长度为813个碱基对，编码水解酶，270个氨基酸；12)与侧链合成相关的SAM自由基蛋白基因，即nosL：nosL位于基因簇核苷酸序列第18316-17114个碱基处，长度为1203个碱基对，编码一个SAM自由基蛋白，400个氨基酸；13)Nosihepide前体肽基因，即nosM：nosM位于基因簇核苷酸序列第18668-18820个碱基处，长度为153个碱基对，编码Nosiheptide前体肽，50个氨基酸；14)SAM依赖的甲基转移酶基因，即nosN：nosN位于基因簇核苷酸序列第18891-20078个碱基处，长度为1188个碱基对，编码SAM依赖的甲基转移酶，395个氨基酸；15)与Nosiheptide后修饰相关具体功能未知基因，即nosO：nosO位于基因簇核苷酸序列第20075-21187个碱基处，长度为1113个碱基对，编码一个具体功能未知的蛋白，370个氨基酸；16)SARP家族调控基因，即nosP：nosP位于基因簇核苷酸序列第21497-22468个碱基处，长度为972个碱基对，编码SARP家族调控基因，323个氨基酸。