染色体跨度的单体型图及其构建方法

摘要

本发明提供了一种染色体跨度的单体型图及其构建方法。构建方法包括对包含待测样本基因组交联位点的测序文库进行测序，得到PE reads；将PE reads分别与参考基因组上的序列进行第一次比对，得到第一比对结果；根据第一比对结果构建PE reads的一致性序列，获得高质量的SNP位点；根据所获取的高质量的SNP位点对每一条reads进行筛选，并从中提取至少含有2个杂合SNP位点的reads；并利用杂合SNP位点构建染色体跨度的单体型图。这种基于全基因组的交联位点的测序数据更全面，因而得到的染色体跨度的单体型图的准确性和分辨率都很高，且具有物种适应范围广的优势。

主权项

一种染色体跨度的单体型图的构建方法，其特征在于，所述构建方法包括：步骤S1，对包含待测样本基因组交联位点的测序文库进行测序，得到PE reads；步骤S2，将所述PE reads分别与参考基因组上的序列进行第一次比对，得到第一比对结果；步骤S3，根据所述第一比对结果构建所述PE reads的一致性序列，获得高质量的SNP位点；以及步骤S4，根据获取的所述高质量的SNP位点对所述PE reads中的每一条reads进行筛选，获得至少含有2个杂合SNP位点的reads；利用所述杂合SNP位点构建所述染色体跨度的单体型图。