甲基化分析

摘要

本发明提供检测甲基化基因组座位的方法。在某些实施方案中，所述方法包括：a）用修饰胞嘧啶为尿嘧啶的试剂处理包含未甲基化和甲基化的基因组座位拷贝的核酸样品以产生经处理的核酸；b）使用第一引物和第二引物从经处理的核酸扩增产物，其中所述第一引物与基因组座位中包含甲基胞嘧啶的位点杂交，所述扩增优选地扩增所述基因组座位的甲基化拷贝，以产生扩增的样品；以及c）使用活瓣分析检测所扩增的样品中所述基因组座位的扩增的甲基化拷贝的存在，所述活瓣分析采用侵入寡核苷酸，其具有相应于基因组座位中甲基化位点的3’末端G或C核苷酸。

主权项

一种检测甲基化的基因组座位的方法，包括：a）用修饰未甲基化胞嘧啶为尿嘧啶的试剂处理包含未甲基化和甲基化的基因组座位拷贝的核酸样品，以产生经处理的核酸；b）使用第一引物和第二引物从所述经处理的核酸扩增产物，其中所述第一引物与所述座位中的甲基化序列杂交，所述扩增优选地扩增所述基因组座位的所述甲基化拷贝，以产生扩增的样品；以及c）使用活瓣分析检测所扩增的样品中所述基因组座位的扩增的甲基化拷贝的存在，所述活瓣分析采用：i.侵入寡核苷酸，其具有相应于所述基因组座位中甲基化胞嘧啶的3’末端G或C核苷酸；和ii.活瓣寡核苷酸，其在相应于所述基因组座位中所述甲基化胞嘧啶的位置包含G或C核苷酸。