一种基于学生t分布的癌症亚型生物标志物检测系统

摘要

本发明涉及一种基于学生t分布的癌症亚型生物标志物检测系统，包括基因表达谱提取单元，从基因芯片中提取基因样本的表达谱；网络聚类模型建立单元，提取到的基因表达谱输入其中，建立混合模型并对其进行求解，其中混合模型使用多元学生t分布来描述每个成分；癌症亚型发现单元，利用混合模型和聚类方法发现新的癌症亚型；基因间相互关系探索单元，将每个基因看作是网络中的点，通过挖掘网络结构探索不同癌症亚型中基因间的相互关系；生物标志物检测单元，根据不同癌症亚型中基因间的相互关系完成与癌症亚型相关的生物标记物的检测。本发明使用多元学生t分布来描述混合模型中的每个成分，使得聚类、变量选择过程对异常点、噪声具有鲁棒性。

主权项

一种基于学生t分布的癌症亚型生物标志物检测系统，其特征在于，包括：基因表达谱提取单元，从基因芯片中提取n个独立的包含d个基因的样本的表达谱χ={x1,…,xn}，其中xi=[xi1 xi2 … xid]表示样本i中d个基因的表达谱；网络聚类模型建立单元，与基因表达谱提取单元连接，提取到的基因表达谱χ={x1,…,xn}输入其中，建立混合模型并对该混合模型进行求解，其中，该混合模型使用多元学生t分布来描述混合模型中的每个成分；癌症亚型发现单元，与网络聚类模型建立单元连接，其利用混合模型和聚类方法发现新的癌症亚型；基因间相互关系探索单元，与癌症亚型发现单元连接，将每个基因看作是网络中的点，通过挖掘网络结构探索不同癌症亚型中基因间的相互关系；生物标志物检测单元，根据不同癌症亚型中基因间的相互关系完成与癌症亚型相关的生物标记物的检测。