发明名称 生物基因组简单重复序列的发掘方法及设备
摘要 本发明公开了一种生物基因组简单重复序列的发掘方法,其特征在于,包括以下步骤:根据需要发掘的生物基因组简单重复序列SSR的特征构建正则表达式;通过所述正则表达式分析待分析序列,判断所述待分析序列中是否存在符合所述正则表达式要求的目标SSR,如果判断结果为是,则输出所述目标SSR;如果判断结果为否,则显示所述待分析序列中不存在所述目标SSR的信息。因此,本发明提供的生物基因组简单重复序列的发掘方法及设备,在对SSR发掘过程中,不会产生冗余结果,从而降低了SSR发掘过程的配置复杂度,提高了SSR发掘的效率,降低了SSR发掘软件的开发难度。
申请公布号 CN102495977A 申请公布日期 2012.06.13
申请号 CN201110414015.9 申请日期 2011.12.13
申请人 中国农业科学院烟草研究所 发明人 任民;王志德;刘艳华;张兴伟;牟建民
分类号 G06F19/24(2011.01)I 主分类号 G06F19/24(2011.01)I
代理机构 北京市盛峰律师事务所 11337 代理人 赵建刚
主权项 一种生物基因组简单重复序列的发掘方法,其特征在于,包括以下步骤:根据需要发掘的生物基因组简单重复序列SSR的特征构建正则表达式;通过所述正则表达式分析待分析序列,判断所述待分析序列中是否存在符合所述正则表达式要求的目标SSR,如果判断结果为是,则输出所述目标SSR;如果判断结果为否,则显示所述待分析序列中不存在所述目标SSR的信息。
地址 266101 山东省青岛市崂山区科苑经四路11号