发明名称 | 生物基因组简单重复序列的发掘方法及设备 | ||
摘要 | 本发明公开了一种生物基因组简单重复序列的发掘方法,其特征在于,包括以下步骤:根据需要发掘的生物基因组简单重复序列SSR的特征构建正则表达式;通过所述正则表达式分析待分析序列,判断所述待分析序列中是否存在符合所述正则表达式要求的目标SSR,如果判断结果为是,则输出所述目标SSR;如果判断结果为否,则显示所述待分析序列中不存在所述目标SSR的信息。因此,本发明提供的生物基因组简单重复序列的发掘方法及设备,在对SSR发掘过程中,不会产生冗余结果,从而降低了SSR发掘过程的配置复杂度,提高了SSR发掘的效率,降低了SSR发掘软件的开发难度。 | ||
申请公布号 | CN102495977A | 申请公布日期 | 2012.06.13 |
申请号 | CN201110414015.9 | 申请日期 | 2011.12.13 |
申请人 | 中国农业科学院烟草研究所 | 发明人 | 任民;王志德;刘艳华;张兴伟;牟建民 |
分类号 | G06F19/24(2011.01)I | 主分类号 | G06F19/24(2011.01)I |
代理机构 | 北京市盛峰律师事务所 11337 | 代理人 | 赵建刚 |
主权项 | 一种生物基因组简单重复序列的发掘方法,其特征在于,包括以下步骤:根据需要发掘的生物基因组简单重复序列SSR的特征构建正则表达式;通过所述正则表达式分析待分析序列,判断所述待分析序列中是否存在符合所述正则表达式要求的目标SSR,如果判断结果为是,则输出所述目标SSR;如果判断结果为否,则显示所述待分析序列中不存在所述目标SSR的信息。 | ||
地址 | 266101 山东省青岛市崂山区科苑经四路11号 |