检测人乳头瘤病毒的基因芯片及试剂盒

摘要

本发明公开了一种检测人乳头瘤病毒的基因芯片，包括固相载体和固定在该固相载体上的人乳头瘤病毒检测探针，所述检测探针包括SEQ ID No.9-37的核苷酸序列；本发明的27种HPV亚型特异性探针，对应包括了22种高危及中危型HPV，5种低危型HPV和2种高危型HPV整合(HPV16/HPV18)。本发明还公开了一种快速、高通量的检测样本中HPV各亚型的检测试剂盒，包括基因芯片，固定于其上的检测探针为SEQ ID No.9-37的核苷酸序列；检测用引物序列，用于扩增临床样本中的人乳头瘤病毒DNA序列；用于扩增临床样本中的人GAPDH基因；人乳头瘤病毒专用裂解液；PCR反应液和显色试剂。本发明的HPV检测对于HPV的临床诊断和宫颈癌的早期预防、诊断、治疗和术后跟踪有重大意义。

主权项

一种检测人乳头瘤病毒的基因芯片，包括固相载体和固定在该固相载体上的人乳头瘤病毒检测探针，其特征在于，所述检测探针由SEQ ID No.9‑37的核苷酸序列组成：HPV6:5’‑AACTACATCTTCCACATACAC‑3’  （SEQ ID No.9）HPV11:5’‑GTCTAAATCTGCTACATACAC‑3’  （SEQ ID No.10）HPV16:5’‑ATTATGTGCTGCCATATCTACTT‑3’ （SEQ ID No.11）HPV18:5’‑ACAGTCTCCTGTACCTGGG‑3’ （SEQ ID No.12）HPV31:5’‑CCAATATGTCTGTTTGTGCTGC‑3’ （SEQ ID No.13）HPV33:5’‑GTACTAATATGACTTTATGC‑3’  （SEQ ID No.14）HPV35:5’‑GTGTTCTGCTGTGTCTTCTAGT‑3’（SEQ ID No.15）HPV39:5’‑TATAGAGTCTTCCATACCT‑3’ （SEQ ID No.16）HPV40:5’‑CCCCACACCAACCCCATATAA‑3’ （SEQ ID No.17）HPV42:5’‑CATGACTTTGTGTGCCACTG‑3’ （SEQ ID No.18）HPV43:5’‑CGTTATGTGCCTCTACTGACC‑3’ （SEQ ID No.19）HPV44:5’‑CTACACAGTCCCCTCC‑3’ （SEQ ID No.20）HPV45:5’‑CTCTACACAAAATCCTGTG‑3’ （SEQ ID No.21）HPV51:5’‑CTGCTGCGGTTTCC‑3’（SEQ ID No.22）HPV52:5’‑TTTATGTGCTGAGGTTAAAAAG‑3（SEQ ID No.23）HPV53:5’‑CGCAACCACACAGTCTATG‑3’ （SEQ ID No.24）HPV54:5’‑ACAGCATCCACGCAGG‑3’ （SEQ ID No.25）HPV56:5’‑CAGAACAGTTAAGTAAATATGAT‑3’ （SEQ ID No.26）HPV58:5’‑CACTGAAGTAACTAAGG‑3’ （SEQ ID No.27）HPV59:5’‑TTCTACTACTTCTTCTATTCCTAA‑3’（SEQ ID No.28）HPV66:5’‑TAATGCAGCTAAAAGC‑3’  （SEQ ID No.29）HPV68:5’‑TTTGTCTACTACTACTGAATCA‑3’（SEQ ID No.30）HPV70: 5’‑AACGGCCATACCTGCTGTATAT‑3’ （SEQ ID No.31）HPV73:5’‑TAGGTACACAGGCTAGTAG‑3’ （SEQ ID No.32）HPV83:5’‑GCTACACAGGCTAATGAATACACA‑3’（SEQ ID No.33）HPVmm4:5’‑CACTGCTGTTACTCAATCTG‑3’ （SEQ ID No.34）HPVCP8304:5’‑GCTACATCTGCTGCT‑3’     （SEQ ID No.35）GP: 5’‑GGAGCCAAAAGGGTCATCATCT‑3’ （SEQ ID No.36）ALU: 5’‑AGCTACTCGGGAGGCTGAGGC‑3’ （SEQ ID No.37）