发明名称 | 达托霉素生产菌玫瑰孢链霉菌的代谢网络分析方法 | ||
摘要 | 本发明涉及达托霉素生产菌玫瑰孢链霉菌的代谢网络分析方法。1)根据糖酵解途径、戊糖磷酸途径、柠檬酸循环、回补反应和细胞合成反应的达托霉素合成反应,构建出中心代谢网络模型;2)将代谢网络模型转化为矩阵S(m×n),收集发酵液,测量细胞干重、葡萄糖消耗速率、达托霉素生成速率和细胞生长速率;根据已知通量,求出未知通量。本发明将代谢网络分析技术应用于玫瑰孢链霉菌的代谢通量分析,通过测量胞外物质的代谢通量,计算得到胞内反应的代谢通量,反应出葡萄糖被菌体利用后在糖酵解途径、戊糖磷酸途径、柠檬酸循环和回补反应的分布情况,为定量化研究玫瑰孢链霉菌胞内的代谢特性提供了一个新的方法。 | ||
申请公布号 | CN101777094B | 申请公布日期 | 2011.11.16 |
申请号 | CN201010103477.4 | 申请日期 | 2010.02.01 |
申请人 | 天津大学 | 发明人 | 闻建平;王国英;贾晓强;黄笛 |
分类号 | G06F19/12(2011.01)I | 主分类号 | G06F19/12(2011.01)I |
代理机构 | 天津市北洋有限责任专利代理事务所 12201 | 代理人 | 王丽 |
主权项 | 1.达托霉素生产菌玫瑰孢链霉菌的代谢网络分析方法,其特征是:1)根据生物化学中代谢反应原理、细胞组成和达托霉素分子组成,构建出中心代谢网络;2)将代谢网络转化为矩阵S(m×n),其中m为胞内代谢物,n为反应,S(m,n)表示代谢物m在反应n中的计量系数,且有V表示反应通量,V为n维向量,在稳态条件下胞内代谢物的累积速率为0,则有S<sub>C</sub>V<sub>C</sub>+S<sub>K</sub>V<sub>K</sub>=0,其中下标C表示未知通量的下标,K表示已知通量的下标,Vc表示未知通量,V<sub>K</sub>表示已知通量,未知通量由公式<img file="FSB00000604316800011.GIF" wi="363" he="56" />求出;3)将玫瑰孢链霉菌在发酵罐中进行恒化培养,收集发酵液,测量细胞干重、葡萄糖消耗速率、达托霉素生成速率和细胞生长速率;4)将步骤3中测得的葡萄糖消耗速率、达托霉素生成速率和细胞生长速率分别除以细胞干重,得到比葡萄糖消耗速率、比达托霉素生成速率和比细胞生长速率,则为3个已知通量,带入步骤2中的公式,求出未知通量。 | ||
地址 | 300072 天津市南开区卫津路92号天津大学 |