基于最近邻算法的酶和底物相互作用分类在线预报方法

摘要

本发明公开了一种基于最近邻算法的酶和底物相互作用分类在线预报方法，该方法步骤：(1)建立最近邻算法学训练所需的酶序列和底物官能团数据集；(2)酶和底物数据集转换：将酶序列和底物官能团的数据集转换成可用于模型训练的特征数据集；(3)用最近邻算法学训练酶序列和底物官能团特征数据集；(4)预报所需的酶序列和底物官能团数据的读入、数据的转换及酶和底物相互作用分类的在线预报。该方法预报计算时间短，小于通过实验手段来测定酶是否与底物相互作用时间；成本低，其数据通过国际上一些免费的酶和底物信息数据库获得，无须其他设备和费用；方便快捷。在线预报时，用户只需在预报网页界面提供要预报的酶序列和底物官能团数据。

主权项

一种基于最近邻算法的酶和底物相互作用分类在线预报方法，其特征在于，该方法包括如下步骤：(1)建立最近邻算法学习训练所需的酶序列和底物官能团数据集(2)酶序列和底物官能团数据集转换：将上述步骤(1)得到的酶序列和底物官能团的数据集转换成可用于模型训练的特征数据集；(3)用最近邻算法学习训练上述步骤(2)得到的酶序列和底物官能团的特征数据集；(4)报所需的酶序列和底物官能团数据的读入、其数据的转换及酶和底物相互作用分类的在线预报。