一种人免疫缺陷病毒蛋白酶裂解位点预测及特异性分析方法

摘要

本发明公开了一种人免疫缺陷病毒蛋白酶裂解位点预测及特异性分析方法，能够用于人免疫缺陷病毒蛋白酶裂解位点预测及特异性分析，进而设计更易裂解的肽样本，进一步开发有效的人免疫缺陷病毒蛋白酶抑制剂，包括如下步骤：a)基于主成分分析方法，建立氨基酸0D－3D信息得分矢量；b)应用氨基酸0D－3D信息得分矢量对人免疫缺陷病毒蛋白酶可裂解肽与非裂解肽的结构进行表征；c)用逐步方法挑选与肽裂解密切相关的性质参数；d)应用线性判别分析方法建立裂解位点预测及特异性分析模型；e)分别以自取代检验，留一法交互检验以及外部检验三种方法验证模型的预测能力；f)对人免疫缺陷病毒蛋白酶可裂解肽与非裂解肽的各位点的性质参数进行方差分析。

主权项

1.一种人免疫缺陷病毒蛋白酶裂解位点预测及特异性分析方法，其特征在于包括如下步骤：a)基于主成分分析方法，建立氨基酸0D-3D信息得分矢量；b)应用氨基酸0D-3D信息得分矢量对人免疫缺陷病毒蛋白酶可裂解肽与非裂解肽的结构进行表征；c)用逐步方法挑选与肽裂解密切相关的性质参数；d)应用线性判别分析方法建立裂解位点预测及特异性分析模型；e)分别以自取代检验，留一法交互检验以及外部检验验证模型的预测能力；f)对人免疫缺陷病毒蛋白酶可裂解肽与非裂解肽的各位点的性质参数进行方差分析。