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Beschrieben ist ein Verfahren zur relativen Quantifizierung der Methylierung von Cytosin Basen in DNA-Proben, wobei man folgende Verfahrensschritte ausführt: a) man setzt eine genomische DNA-Probe mit einem Reagenz chemisch um, wobei 5-Methylcytosin und Cytosin unterschiedlich reagieren und diese somit nach der Reaktion ein unterschiedliches Basenpaarungsverhalten in der DNA Duplex zeigen; b) man amplifiziert die DNA Probe, wobei man ein fluoreszenzmarkiertes dCTP-Derivat zusetzt; c) man hybridisiert die amplifizierte DNA Probe an ein oder mehrere immobilisierte Oligomere, wobei die immobilisierten Oligomere jeweils komplementär zu mindestens einem der im Amplifikationsschritt verwendeten Primer sind; und d) man misst die Fluoreszenz der hybridisierten Amplifikate quantitativ.
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