发明名称 核酸靶序列捕获测序文库的制备方法
摘要 本发明公开了核酸靶序列捕获测序文库的制备方法;a)根据目标靶序列设计并合成捕获探针A和B溶液;b)在待测DNA或RNA样品中加入探针A溶液,同时加入DNA聚合酶或逆转录酶、dNTP和含Mg2+的缓冲液,延伸探针A;c)再加入链霉亲合素包被的磁珠与探针A结合并洗涤磁珠;d)在含有磁珠的缓冲液中再添加探针B溶液;e)在缓冲液中加入DNA聚合酶、dNTP和含Mg2+的缓冲液延伸探针B;f)洗涤磁珠,通过加热变性使捕获探针B延伸产物从磁珠上解离洗脱下来;g)以捕获探针B延伸产物为模板,用公共引物a和b进行文库PCR扩增,本发明具有高通量、高特异性、高灵敏度、操作方便、操作成本低、适用范围广。
申请公布号 CN105734679A 申请公布日期 2016.07.06
申请号 CN201610185978.9 申请日期 2016.03.29
申请人 重庆市肿瘤研究所 发明人 施小龙;唐超;张海伟;李丽仙;辇伟奇
分类号 C40B50/06(2006.01)I;C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C40B50/06(2006.01)I
代理机构 重庆信航知识产权代理有限公司 50218 代理人 穆祥维
主权项 一种核酸靶序列捕获测序文库的制备方法,其特征在于:其步骤如下:a)根据目标靶序列设计并合成两组捕获探针A和B溶液;捕获探针A溶液中捕获探针A(1,2,3…n)的结构从5’到3’端分别是:生物素标记、公共序列P1和与靶序列一侧互补的特异性捕获引物序列a(1,2,3…n);捕获探针B溶液中捕获探针B(1,2,3…n)的结构从5’到3’端分别是:公共序列P2和与靶序列一侧相同的特异性引物序列b(1,2,3…n);b)在待测的DNA或RNA样品中首先加入捕获探针A溶液,然后同时加入DNA延伸所需的DNA聚合酶或逆转录酶、dNTP和含Mg2+的缓冲液,捕获探针A通过其3’端的靶特异性序列a(1,2,3…n)和待测样品中的互补DNA或RNA链杂交,并且探针的3’末端在DNA聚合酶或逆转录酶的作用下以靶序列为模板进行DNA合成,将靶序列复制到捕获探针A上,形成有靶序列的捕获探针A单链,捕获探针A单链的结构为:从5’到3’端分别是生物素标记,公共引物序列P1,特异性引物序列,目标靶序列;c)再加入链霉亲合素包被的磁珠,捕获探针A通过其5’末端的生物素标记结合到链霉亲合素包被的磁珠上,然后分离磁珠,将反应液去除,洗涤磁珠,去除非特异性吸附;将结合有捕获探针A延伸产物的磁珠重新悬浮在缓冲液中;d)在含有磁珠的缓冲液中再添加捕获探针B溶液,捕获探针B通过其3’末端的靶特异性序列与捕获探针A上复制的目标靶序列单链互补区域杂交,然后洗涤磁珠去除非特异性吸附,将磁珠重新悬浮在缓冲液中;E)在缓冲液中加入DNA聚合酶、dNTP和含Mg2+的缓冲液,杂交的捕获探针B的3’末端以捕获探针A延伸产物为模板进行DNA合成,捕获探针B延伸产物的结构为:公共引物序列P2‑B组特异性引物序列‑目标靶序列‑A组特异性引物序列‑公共引物序列P1;F)洗涤磁珠,通过加热变性使捕获探针B延伸产物从磁珠上解离洗脱下来;收集捕获探针B延伸产物;G)以捕获探针B延伸产物为模板,用公共引物a和b进行文库PCR扩增;扩增产物即为靶序列捕获测序文库。
地址 400030 重庆市沙坪坝区汉渝路181号
您可能感兴趣的专利