确定蛋白质疏水能量的方法与装置

摘要

本发明公开了一种确定蛋白质疏水能量的方法与装置。其中，确定蛋白质疏水能量的方法包括：根据各氨基酸的空间坐标，确定各氨基酸与其他氨基酸之间的距离；基于所确定的氨基酸之间的距离，确定各氨基酸的包埋系数；以及基于所述各氨基酸的包埋系数，确定所述蛋白质疏水能量。利用该方法，能够有效确定蛋白质疏水能量。

主权项

一种确定蛋白质疏水能量的方法，所述蛋白质由多个氨基酸构成，其特征在于，所述方法包括：根据各氨基酸的空间坐标，确定各氨基酸与其他氨基酸之间的距离；基于所确定的氨基酸之间的距离，确定各氨基酸的包埋系数；以及基于所述各氨基酸的包埋系数，确定所述蛋白质疏水能量，其中，基于所确定的氨基酸之间的距离，确定各氨基酸的包埋系数进一步包括：基于所述各氨基酸与其他氨基酸之间的距离，确定所述各氨基酸之间的残基相邻关系；针对每个氨基酸，基于与其相邻的氨基酸数目，确定各氨基酸的包埋系数，确定所述多个氨基酸之间的残基相邻关系的原则为：设是残基A中原子i与残基B中原子j之间的距离，d^AB是残基A和B表面之间范德华力的作用范围，原子i的半径为r_i，原子j的半径为r_j，则满足下式时，残基A和B相互接触，互为邻居：$r_{\mathrm{ij}}^{\mathrm{AB}}<r_i+r_j+d^{\mathrm{AB}},$所述d^AB为5埃。