利用核糖体DNA序列构建核苷酸分子式鉴定植物品种的方法

摘要

本发明公开了一种鉴定植物品种的方法。本发明提供了鉴定紫薇品种的方法，包括如下步骤：1）以待测紫薇的基因组DNA为模板，用由序列1和序列2所示的两条单链DNA分子组成的引物对进行PCR扩增，得到PCR产物；2）将所述PCR产物测序，根据测序结果列出所述待测紫薇的核苷酸分子式；3）将步骤2）所得的核苷酸分子式与对应的若干个紫薇品种的核苷酸分子式进行比对，从而确定所述待测紫薇的品种。实验证明，该方法精确、操作简捷，可以提高相关产业的生产效率和质量监控水平，有效弥补以往方法的不足；另外，该方法同时实现了非花期（如苗期）的鉴定。本方法对于促进紫薇的新品种选育、紫薇花木产业和城市园林绿化的发展以及环境保护具有重要意义。

主权项

一种鉴定或辅助鉴定待测紫薇品种的方法，包括如下步骤：（1）以待测紫薇的基因组DNA为模板，用由序列表中序列1和序列2所示的两条单链DNA分子组成的引物对进行PCR扩增，得到PCR产物；（2）将所述PCR产物测序，根据测序结果列出所述待测紫薇的核苷酸分子式；所述待测紫薇的核苷酸分子式的通式为：B₁₅B₁₆B₉₉B₁₀₂B₃₃₉B₃₄₆B₄₆₇；在所述通式中，所述B₁₅、所述B₁₆、所述B₉₉、所述B₁₀₂、所述B₃₃₉、所述B₃₄₆和所述B₄₆₇，依次表示在所述PCR产物的核苷酸序列中，将所述PCR产物的核苷酸序列自5’端的第126个碱基记为第1个碱基，沿着所述PCR产物的核苷酸序列向3’端方向顺次计数的第15、16、99、102、339、346和467个碱基；在所述通式中，每一个B为A、T、C和G四种碱基中的一种或两种的叠加；（3）将步骤（2）所得所述待测紫薇的核苷酸分子式与核苷酸分子式组I进行比对；所述核苷酸分子式组I由如下a1）‑a10）共10种核苷酸分子式组成：a1）G₁₅C₁₆T₉₉T₁₀₂T₃₃₉A₃₄₆G₄₆₇；a2）G₁₅C₁₆Y₉₉T₁₀₂Y₃₃₉A₃₄₆G₄₆₇；a3）G₁₅C₁₆Y₉₉Y₁₀₂Y₃₃₉A₃₄₆K₄₆₇；a4）G₁₅C₁₆Y₉₉T₁₀₂Y₃₃₉R₃₄₆G₄₆₇；a5）R₁₅S₁₆Y₉₉W₁₀₂Y₃₃₉R₃₄₆G₄₆₇；a6）R₁₅S₁₆T₉₉W₁₀₂Y₃₃₉R₃₄₆G₄₆₇；a7）G₁₅C₁₆T₉₉W₁₀₂Y₃₃₉R₃₄₆G₄₆₇；a8）G₁₅C₁₆T₉₉Y₁₀₂Y₃₃₉R₃₄₆G₄₆₇；a9）R₁₅S₁₆T₉₉Y₁₀₂Y₃₃₉R₃₄₆G₄₆₇；a10）R₁₅S₁₆T₉₉T₁₀₂Y₃₃₉R₃₄₆G₄₆₇；在a1）‑a10）中，Y表示碱基T和C；K表示G和T；W表示碱基A和T；S表示C和G；R表示碱基A和G；（4）根据步骤（3）的比对结果，按照如下方法对所述待测紫薇进行品种鉴定：若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a1）所示的核苷酸分子式，则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘红环直枝紫’；若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a2）所示的核苷酸分子式，则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘绿爪红蝶’；若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a3）所示的核苷酸分子式，则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘白密香’；若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a4）所示的核苷酸分子式，则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘黄药粉晶’；若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a5）所示的核苷酸分子式，则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘皱瓣堇薇’；若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a6）所示的核苷酸分子式，则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘建民红’；若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a7）所示的核苷酸分子式，则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘直萼红爪粉’；若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a8）所示的核苷酸分子式，则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘宝庆紫’；若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a9）所示的核苷酸分子式，则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘长爪珊瑚堇薇’；若所述待测紫薇的核苷酸分子式为a10）所示的核苷酸分子式，则所述待测紫薇为或候选为紫薇品种‘大花翠盘堇薇’。