一种CYP2C19基因SNP检测特异性引物和液相芯片

摘要

本发明公开了一种CYP2C19基因SNP检测特异性引物和液相芯片，所述液相芯片包括有：由5’端的tag序列和3’端针对目的基因突变的特异性引物组成的ASPE引物，所述特异性引物分别为：SEQ ID NO.25及SEQ ID NO.26、针对C194T SNP位点的SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28、SEQ ID NO.29及SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.31及SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.33及SEQ ID NO.34、SEQ ID NO.35及SEQ ID NO.36、SEQ ID NO.37及SEQ ID NO.38、SEQ ID NO.39及SEQ ID NO.40、SEQ ID NO.41及SEQ ID NO.42、SEQ ID NO.43及SEQ ID NO.44、SEQ ID NO.45及SEQ ID NO.46、和/或SEQ ID NO.47及SEQ ID NO.48；有anti-tag序列包被的微球；扩增引物。本发明所提供的CYP2C 19基因SNP检测液相芯片的检测结果与测序法的吻合率高达100％。

主权项

一种CYP2C19基因SNP检测液相芯片，其特征在于，主要包括有：(A).针对每种SNP分别设计的野生型和突变型的ASPE引物：每种ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的基因SNP位点的特异性引物组成，所述野生型和突变型的特异性引物分别为：针对A96G SNP位点的SEQ ID NO.25及SEQ IDNO.26、针对C194T SNP位点的SEQ ID NO.27及SEQ ID NO.28、针对A77G SNP位点的SEQ ID NO.29及SEQ ID NO.30、针对G147A SNP位点的SEQ ID NO.31及SEQID NO.32、针对A78G SNP位点的SEQ ID NO.33及SEQ ID NO.34、针对C196T SNP位点的SEQ ID NO.35及SEQ ID NO.36、针对C117T SNP位点的SEQ ID NO.37及SEQ ID NO.38、针对T258A SNP位点的SEQ ID NO.39及SEQ ID NO.40、针对A95CSNP位点的SEQ ID NO.41及SEQ ID NO.42、针对C126T SNP位点的SEQ ID NO.43及SEQ ID NO.44、针对C72T SNP位点的SEQ ID NO.45及SEQ ID NO.46、和/或针对G107A SNP位点的SEQ ID NO.47及SEQ ID NO.48；所述tag序列选自SEQ IDNO.1‑24；(B).有anti‑tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球，所述anti‑tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述anti‑tag序列选自SEQ ID NO.49～SEQ IDNO.72中的序列，且所述anti‑tag序列能相应地与(A)中所选的tag序列互补配对；(C).用于扩增出需要检测的、具有相应SNP位点的目标序列的引物。