具有由单核苷或单核苷酸衍生的结构的化合物、核酸、标记物以及核酸检测方法和试剂盒

摘要

本发明提供了能够有效地检测例如核酸双螺旋结构的标记物。提供了具有衍生自单核苷或单核苷酸的结构的化合物、其互变异构体或立体异构体、或其盐，其中所述结构由所述式(1)、(1b)或(1c)表示。例如，B为具有核酸碱基骨架的原子团，E为具有脱氧核糖骨架、核糖骨架或自其衍生的结构的原子团，或具有肽结构或拟肽结构的原子团，Z¹¹和Z¹²分别表示氢原子、保护基或展现出荧光性的原子团，可以相同或者不同。

主权项

1.具有衍生自单核苷或单核苷酸的结构的化合物、其互变异构体或立体异构体，或其盐，其中所述结构以下述式(1)、(1b)或(1c)表示，[化1]在所述式(1)、(1b)和(1c)中，B为具有天然核酸碱基(腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶或尿嘧啶)骨架或者人工核酸碱基骨架的原子团，E为(i)具有脱氧核糖骨架、核糖骨架或由这其中的任一骨架衍生的结构的原子团，或(ii)具有肽结构或拟肽结构的原子团，Z¹¹和Z¹²分别表示氢原子、保护基或展现出荧光性的原子团，可以相同或者不同，Q在E为前述(i)的原子团时，为O，E为前述(ii)的原子团时，为NH，X在E为前述(i)的原子团时，为氢原子、能够用酸脱保护的羟基保护基、磷酸酯基(单磷酸酯基)、二磷酸酯基或三磷酸酯基，E为前述(ii)的原子团时，为氢原子或氨基保护基，Y在E为前述(i)的原子团时，为氢原子、羟基保护基或亚磷酰胺基，E为前述(ii)的原子团时，为氢原子或保护基，L¹、L²和L³各自为连接体(桥连原子或原子团)，主链长(主链原子数)任意，在主链中，各自均可以含有或不含C、N、O、S、P和Si，在主链中，各自均可以含有或不含单键、双键、三键、酰胺键、酯键、二硫键、亚胺基、醚键、硫醚键和硫酯键，L¹、L²和L³彼此之间可以相同或不同，D为CR、N、P、P＝O、B或SiR，R为氢原子、烷基或任意取代基，b为单键、双键或三键，或者，在所述式(1)中，L¹和L²为所述连接体，L³、D和b不存在，L¹和L²直接连接于B，所述式(1b)中、T在E为前述(i)的原子团时，为磷酸桥连(PO₄^-)，其中1个以上的氧原子(O)可由硫原子(S)替代，E为前述(ii)的原子团时，为NH。