环脂肽抗生素罗克霉素生物合成相关的基因簇

摘要

本发明涉及环脂肽抗生素罗克霉素(Locillomycin)合成的基因簇，具体说是一种由枯草芽胞杆菌产生的具有抗细菌和病毒的新型环脂肽抗生素-罗克霉素(locillomycin)的生物合成基因簇的克隆、测序、分析、功能研究及其应用。整个基因簇包括10个基因：4个与罗克霉素大环生物合成相关的基因，2个调控相关基因，4个转运相关的基因。通过对上述相关基因的遗传操作可阻断或影响罗克霉素的合成。本发明所提供的基因及其蛋白也可以用来寻找和发现可用于医药、工业或农业的化合物或基因、蛋白。

主权项

一种具有广谱抗菌，特别是抗病毒活性的环脂肽抗生素‑罗克霉素的生物合成基因，其特征在于，所述的基因选自下组： 1)LocD基因： LocD的核酸序列为SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列第7565‑11446个碱基，长度为3882个碱基，编码1293个氨基酸的蛋白，其氨基酸序列如SEQ ID NO：4所示； 2)LocA基因 LocA的核酸序列为SEQ NO：1所示的核苷酸序列第11667‑18644个碱基，长度为6978个碱基，编码2325个氨基酸的蛋白，其氨基酸序列如SEQ ID NO：5所示； 3)LocB基因 LocB的核酸序列为SEQ NO：1所示的核苷酸序列第18726‑30332个碱基，长度为11607个碱基，编码3868个氨基酸的蛋白，其氨基酸序列如SEQ ID NO：6所示； 4)LocC基因： LocC的核酸序列为SEQ NO：1所示的核苷酸序列第30402‑36782个碱基，长度为6381个碱基，编码2126个氨基酸的蛋白，其氨基酸序列如SEQ ID NO：7所示。