新型癌症标记物

摘要

本发明涉及一种用于癌症中基因启动子的超甲基化的新型标记物。更具体地说，本发明涉及一种确定在呼吸消化系统内是否发生肿瘤，或者对所述肿瘤进行治疗后受试者是否复发的方法。本方法包括测定选自由CNRIP1、SPG20、FBN1、SNCA和INA所组成的组中一个或多个的基因的启动子区域、第一外显子或内含子中核酸序列中的甲基化水平、甲基化的CpG位点的数量或CpG位点的甲基化状态。本方法还涉及用来测定呼吸消化道中的肿瘤的诊断试剂盒。

主权项

与CNRIP1基因的启动子区域中核酸序列互补的一个或多个寡核苷酸引物或一组或多组寡核苷酸引物在制备测定受试者是否已经发生、正在发生、易于发生结肠直肠癌症、或者在结肠直肠癌症的治疗后是否复发的试剂盒中的应用，所述CNRIP1基因由ensembl基因编号ENSG00000119865、entrez编号25927所确定，该应用包括以下步骤：a)测定从所述受试者获得的样品中的CNRIP1的启动子区域中核酸序列中的甲基化水平、甲基化的CpG位点的数量或CpG位点的甲基化状态，b)与参照物比较所述甲基化水平、甲基化的CpG位点的数量或CpG位点的甲基化状态；和c)如果甲基化水平、甲基化的CpG位点的数量或CpG位点的甲基化状态高于参照物的甲基化水平、甲基化的CpG位点的数量或CpG位点的甲基化状态，则将所述受试者确定为可能：发生了、正在发生或易于发生所述癌症、或在所述癌症治疗后复发，如果甲基化水平、甲基化的CpG位点的数量或CpG位点的甲基化状态低于所述参照物的甲基化水平、甲基化的CpG位点的数量或CpG位点的甲基化状态，则将所述受试者确定为不太可能：发生了、正在发生或易于发生所述癌症、或在所述癌症治疗后复发。