主权项 |
产生能够改变靶蛋白活性的小分子化合物的方法,所述方法包括:(a)获得结合靶蛋白并改变所述靶蛋白生物学活性的一种或多种抗体或其片段(b)生成步骤(a)中所获得的抗体与靶蛋白相缔合的三维结构表示并且鉴别靶蛋白和抗体上彼此相互作用且落入抗体的结合位点内的一对或多对接触原子(c)获得结合靶蛋白的一种或多种化合物片段(d)生成步骤(c)中所获得的一种或多种片段与靶蛋白相缔合的三维结构表示(e)选择在步骤(b)中所鉴别的抗体结合位点内或其邻近处结合靶蛋白的化合物片段(f)生长步骤(e)中所选择的化合物片段以产生一种或多种候选化合物,所述候选化合物与步骤(b)中所鉴别的靶蛋白上的一个或多个接触原子相互作用,任选地是通过指引所述化合物片段的化学生长从而使得延伸的片段占据与步骤(b)中所鉴别的抗体上的一个或多个接触原子相同的化学空间或3D位置(g)就下列测试步骤(f)中所产生的一种或多种候选化合物:对靶蛋白改善的亲和力和/或改善的效力和/或改变靶蛋白生物学活性的能力(h)选择步骤(g)中所测试的化合物,如果其调节靶蛋白的活性或具有改善的结合亲和力或配体效率的话(i)任选地,使用步骤(h)中所鉴别的化合物进行进一步的化学作用和筛选以产生调节靶蛋白活性的小分子化合物。 |