发明名称 早期检测消化道肿瘤细胞经外周血微转移的方法
摘要 早期检测消化道肿瘤细胞经外周血微转移的方法,涉及CK19mRNA、CK20mRNA及CEAmRNA检测上皮性消化道肿瘤细胞经外周血微转移方法。提供采用分子生物学手段综合CK19mRNA、CK20 mRNA和CEA mRNA三项指标,微量准确快速检测上皮性消化道肿瘤细胞经外周血微转移的方法。步骤为采血,离心,获取血液中的有核细胞,提取总RNA,RNA检测并鉴定其完整性,要求OD<SUB>260</SUB>/OD<SUB>280</SUB>比值>1.8,合成cDNA第一链,对CK19c DNA和CK20c DNA的巢式PCR扩增,再对CEA的cDNA第一链进行巢式PCR扩增,三项指标联合检测消化道肿瘤细胞经外周血微转移后统计学计算。
申请公布号 CN1824810A 申请公布日期 2006.08.30
申请号 CN200510129964.7 申请日期 2005.12.16
申请人 厦门大学 发明人 刘广发;游攀;张忠英;黄如欣
分类号 C12Q1/68(2006.01);G01N27/447(2006.01);G01N33/50(2006.01) 主分类号 C12Q1/68(2006.01)
代理机构 厦门南强之路专利事务所 代理人 马应森;戴深峻
主权项 1、早期检测消化道肿瘤细胞经外周血微转移的方法,其特征在于具体步骤如下:1)采血:抽取外周静脉血3~5mL,注入含肝素钠的洁净试管中;2)准备离心:取步骤1)所得的肝素抗凝静脉血与Hank氏液等量混匀,分别在两支试管中加入2~4mL的淋巴细胞分离液,再将上述混合液5~10mL叠加于淋巴细胞分离液的液面上;3)获取血液中的有核细胞:将步骤2)中的试管经2000~2500g水平离心15~20min后溶液分为3层,上层为血浆和Hank氏液,中层为淋巴细胞分离液,下层主要为红细胞和粒细胞,在上、中层界面处有一以有核细胞为主的白色狭窄带,用干净毛细管插到该白色狭窄带层,吸出有核细胞,并移入试管中,加入1~5mL Hank氏液,洗涤细胞,1500~2000g水平离心10~15min,弃上清液;4)提取总RNA:在已经洗涤过的有核细胞沉淀中加入Trizol试剂1~5mL,消化3~5min;将细胞裂解液吸到EP管中,加氯仿0.2~1.0mL,轻摇15~60s,室温静置5~10min,10000~12000g离心10~15min,取上清无色水相液到EP管中,加异丙醇0.5~1.5mL,静置10~20min,10000~12000g离心10~15min,弃上清,在管底见微量白色总RNA沉淀;5)RNA检测:用无水乙醇洗涤RNA沉淀后,10000~12000g离心5~10min,吸尽上清液,在超净台中以无菌风吹干残余乙醇,加入无菌双蒸水10~20μL,打匀,55~60℃水浴10-20min溶解总RNA,测OD260和OD280值,检测其纯度,在琼脂糖凝胶中电泳,鉴定所提取RNA的完整性;6)若OD260/OD280比值>1.8,说明RNA的纯度较高,则进入后续实验;若OD260/OD280比值<1.8,说明RNA的纯度不够,应重复步骤4),直至符合要求即OD260/OD280比值>1.8为止;若在琼脂糖凝胶电泳中至少能见到两条界限分明的RNA带,说明RNA质量较高,降解较少,否则应重新提取总RNA;7)cDNA第一链的合成:取上述总RNA 1~5μL于EP管中,70℃水浴10min,在冰浴中依次加入:0ligo(dT)15引物1μL,10×缓冲液2μL,dNTPs 2μL,RNasin 0.5μL,AMV反转录酶4.3μL(3.5u/μL),双蒸水5.2~9.2μL,混匀,整个反应体系移42℃孵育15min,接着95℃ 5min,最后0~5℃ 5min,经反转录获得各种cDNA的第一链;8)CK19 cDNA的巢式PCR扩增:对CK19的cDNA第一链进行巢式PCR扩增和检测的第一轮扩增体系包括:反转录产物3~5μL,无菌双蒸水11.8~13.8μL,10×缓冲液2.5μL,dNTPs 2.0μL,CK19 A(5′GAGGTGGATTCCGCTCCGGGCA 3′)和CK19 B(5′ATCTTCCTGTCCCTCGAGCAG 3′)各1.0μL(10pmol/μL),Taq DNA聚合酶0.2μL(5U/μL),MgCl2 1.5μL,共25μL;反应条件如下:94℃变性1min,60℃退火1min,72℃延伸1min,循环40次;第一轮PCR扩增后立即进行第二轮PCR扩增,反应体系包括:第一轮PCR扩增产物0.5μL,无菌双蒸水16.3μL,10×缓冲液2.5μL,dNTPs 2.0μL,CK19 C(5′CGAGCAGAACCGGAA3′)和CK19 D(5′TGAGCCG CTGGTACTCCTGAT 3′)各1.0μL(10pmol/μL),Taq DNA聚合酶0.2μL(5U/μL),MgCl2 1.5μL,共25μL,第2轮PCR扩增除退火温度为52℃外,其余反应条件同第一轮反应。取上述巢式第二轮PCR扩增产物4~8μL在1.0%~1.5%的琼脂糖凝胶上电泳,溴乙锭染色,紫外灯下观察并扫描成像,登记阳性或阴性结果并与临床分期和病理结果进行比对;9)CK20 cDNA的巢式PCR扩增:CK20巢式PCR扩增的体系类似CK19,在提取获得纯度较高的RNA后,将其中的mRNA反转录为cDNA,然后进行巢式PCR扩增,第一轮扩增引物为CK20 A(5′CAGACACACGGTGAACTATGG 3′)和CK20 B(5′GATCAGCTTCCACTGTTAGACG 3′)。反应条件:94℃变性30s,63℃退火1min,72℃延伸30s,循环35次;第二轮扩增引物为CK20 C(5′CTGTTTGTTGG CAATGAGAAAATGG 3′)和CK20 D(5′GTATTCCTCTCTCAGTCTCATACT3′),退火温度为62℃ 1min,72℃延伸30s,循环35次;扩增后取扩增产物4~8μL在1.0%~1.5%的琼脂糖凝胶上电泳,溴乙锭染色,紫外灯下观察并扫描成像,登记并与临床分期和病理结果进行比对;10)对CEA的cDNA第一链进行巢式PCR扩增:CEA巢式PCR扩增的体系类似CK19,在提取获得纯度较高的RNA后,将其中的mRNA反转录为cDNA,然后进行巢式PCR扩增,其第一轮引物为CEA A(5′TCTGGAACTTCTCCTGGTCTCTCAGCTGG 3′)和CEA B(5′TGTAGCTGTTGCAAATGCTTAAGGAAGAAGC 3′),反应条件:先94℃预热5min,接着94℃变性45s,65℃退火45s,72℃延伸45s,循环22次;第二轮扩增的引物为CEA B(5′TGTAGCTGTTGCAAATGCTTTAAGGAAGAAGC3′)和CEA C(5′GGGCCACTGTCGGCATCATGATTGG 3′),反应条件同上述第一轮;反应后取扩增产物4~8μL在1.0%~1.5%的琼脂糖凝胶上电泳,溴乙锭染色,紫外灯下观察并扫描成像,登记并与临床分期和病理结果进行比对;11)三项指标联合检测消化道肿瘤细胞经外周血微转移:对待检者按上述步骤依次检测外周静脉血中有核细胞的CK19 mRNA、CK20 mRNA和CEA mRNA,并将三项结果一并考察,只要其中任何一项为阳性,该待检者体内发生消化道肿瘤细胞微转移的可能性高达91.9%。如果三项检测都为阴性,则提示发生消化道肿瘤细胞微转移的可能性很小;12)统计学计算:用SPSS13.0统计软件包进行统计学处理,消化道肿瘤按国际抗癌协会UICC的TNM标准进行分期,各期阳性率的比较采用x2检验,以P<0.05作为显著性差异的判断标准。
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