基于信号谱差异的混合样本单核苷酸多态性的检测方法

摘要

本发明公开了一种基于信号谱差异的混合样本单核苷酸多态性的检测方法，该方法首先利用一种两核苷酸实时合成测序技术对野生型样本和混合样本分别进行三轮独立测序，获得三组信号谱；然后根据三轮测序实验获得的野生型样本与混合样本的信号谱，计算野生型样本与混合样本的信号谱之间的差异，并采用枚举方法推断混合样本中可能存在的单核苷酸多态性位点；最后综合分析三轮测序实验所检测出的可能的单核苷酸多态性位点，进行一致性判断，如果混合样本中含有单核苷酸多态性位点，则归纳出其位置、突变核苷酸及其比例。本发明相比于现有技术，具有更高的准确度；两核苷酸的循环添加顺序不需要经过复杂的实验设计，实验更容易操作，成本低廉。

主权项

一种基于信号谱差异的混合样本单核苷酸多态性的检测方法，其特征在于：包括以下步骤：第一步：提取野生型样本的DNA和混合样本的DNA，进行聚合酶链式反应，得到单链PCR产物，其中，混合样本包括野生型序列和突变型序列；第二步：对野生型样本和混合样本的单链PCR产物进行三轮循环的实时合成测序，获得三组信号谱；第三步：根据三轮测序实验获得的野生型样本与混合样本的信号谱，计算野生型样本与混合样本的信号谱之间的差异，利用枚举方法推断混合样本中可能存在的单核苷酸多态性位点；第四步：综合分析三轮测序实验所检测出的可能的单核苷酸多态性位点，进行一致性判断，判断混合样本中是否存在单核苷酸多态性位点，如果混合样本中含有单核苷酸多态性位点，则归纳出单核苷酸多态性位点的位置、突变核苷酸及突变核苷酸的比例。