发明名称 一种多靶标特异性核酸适体的富集方法
摘要 本发明公开了一种多靶标特异性核酸适体的富集方法。包括如下步骤:1)将待富集核酸文库与非靶细胞孵育,得到与非靶细胞不结合的核酸分子1;2)将核酸分子1依次与N种靶细胞孵育,收集与各靶细胞结合的核酸分子作为下轮待富集文库,重复步骤1)、2),使与N种靶细胞中至少一种特异结合的核酸分子富集;3)将步骤2)富集产物与非靶细胞孵育,得到与非靶细胞不结合的核酸分子2;4)将核酸分子2与N种靶细胞循环孵育,以与前一靶细胞结合的核酸分子作为与下一靶细胞孵育的核酸文库,依次与所有靶细胞孵育,重复步骤3)、4),使与N种靶细胞均特异结合的核酸分子富集。该方法富集的核酸适体高亲和多种靶细胞,在肿瘤诊断中应用前景很大。
申请公布号 CN103725671A 申请公布日期 2014.04.16
申请号 CN201210392478.4 申请日期 2012.10.16
申请人 中国医学科学院肿瘤研究所 发明人 马洁;赵晨;徐丽;袁伟;唐万燕
分类号 C12N15/10(2006.01)I 主分类号 C12N15/10(2006.01)I
代理机构 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人 关畅;任凤华
主权项 一种多靶标特异性核酸适体的富集方法,包括如下步骤:(1)将待富集核酸文库与非靶细胞孵育,分离去除与所述非靶细胞结合的核酸分子,得到与所述非靶细胞不结合的核酸分子;(2)为如下a)或b):a)依次进行如下a1)和a2):a1)将步骤(1)得到的与所述非靶细胞不结合的核酸分子与靶细胞1共同孵育形成孵育体系1,吸出所述孵育体系1中不含所述靶细胞1的液体,将其命名为孵育液1,所述孵育液1中含有与所述靶细胞1不结合的核酸分子;将所述孵育液1与靶细胞2共同孵育,形成孵育体系2,吸出所述孵育体系2中不含所述靶细胞2的液体,将其命名为孵育液2,所述孵育液2中含有与所述靶细胞2不结合的核酸分子;a2)洗涤步骤a1)中孵育后的2种靶细胞,对洗涤后的与所述2种靶细胞结合的所述待富集核酸文库中的核酸分子进行扩增,获得扩增产物,使与所述2种靶细胞中的至少一种特异结合的核酸分子得到富集;b)依次进行如下b1)和b2):b1)将步骤(1)得到的与所述非靶细胞不结合的核酸分子与靶细胞1共同孵育形成孵育体系1,吸出所述孵育体系1中不含所述靶细胞1的液体,将其命名为孵育液1,所述孵育液1中含有与所述靶细胞1不结合的核酸分子;将所述孵育液1与靶细胞2共同孵育形成孵育体系2,吸出所述孵育体系2中不含所述靶细胞2的液体,将其命名为孵育液2,所述孵育液2中含有与所述靶细胞2不结合的核酸分子;依此类推,直至将孵育液N‑1与靶细胞N共同孵育形成孵育体系N,吸出所述孵育体系N中不含所述靶细胞N的液体,将其命名为孵育液N,所述孵育液N中含有与所述靶细胞N不结合的核酸分子;b2)洗涤步骤b1)中孵育后的N种靶细胞,对洗涤后的与所述N种靶细胞结合的所述待富集核酸文库中的核酸分子进行扩增,获得扩增产物,使与所述N种靶细胞中的至少一种特异结合的核酸分子得到富集;所述N为3以上的自然数;(3)以步骤(2)a2)中得到的扩增产物或步骤(2)b2)中得到的扩增产物作为待富集核酸文库,将所述待富集核酸文库与所述非靶细胞孵育,分离去除与所述非靶细胞结合的核酸分子,得到与所述非靶细胞不结合的核酸分子;(4)为如下c)或d):c)将步骤(3)得到的与所述非靶细胞不结合的核酸分子与所述靶细胞1共同孵育,收集并洗涤孵育后的所述靶细胞1,对洗涤后的与所述靶细胞1所结合的所述待富集核酸文库中的核酸分子进行扩增,获得扩增产物1,使与所述靶细胞1特异结合的核酸分子得到富集;将所述扩增产物1与所述靶细胞2共同孵育,收集并洗涤孵育后的所述靶细胞2,对洗涤后的与所述靶细胞2所结合的所述待富集核酸文库中的核酸分子进行扩增,获得扩增产物2,使与所述靶细胞1和所述靶细胞2均特异结合的核酸分子得到富集;d)将步骤(3)得到的与所述非靶细胞不结合的核酸分子与所述靶细胞1共同孵育,收集并洗涤孵育后的所述靶细胞1,对洗涤后的与所述靶细胞1所结合的所述待富集核酸文库中的核酸分子进行扩增,获得扩增产物1,使与所述靶细胞1特异结合的核酸分子得到富集;将所述扩增产物1与所述靶细胞2共同孵育,收集并洗涤孵育后的所述靶细胞2,对洗涤后的与所述靶细胞2所结合的所述待富集核酸文库中的核酸分子进行扩增,获得扩增产物2,使与所述靶细胞1和所述靶细胞2均特异结合的核酸分子得到富集;依此类推,直至将扩增产物N‑1与所述靶细胞N共同孵育,收集并洗涤孵育后的所述靶细胞N,对洗涤后的与所述靶细胞N所结合的所述待富集核酸文库中的核酸分子进行扩增,获得扩增产物N,使与所述N种靶细胞均特异结合的核酸分子得到富集;所述N为3以上的自然数。
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