安徽地方猪种抗病性状候选遗传标记的筛选方法

摘要

本发明公开了一种安徽地方猪种抗病性状候选遗传标记的筛选方法，包括如下步骤：(1)选择对照动物模型；(2)样品采集；(3)耳组织DNA提取；(4)PCR扩增TAP1基因目的片段；(5)单链构象多态性分析；(6)PCR扩增产物双向测序；(7)群体遗传学特性分析；(8)血清免疫指标的测定；(9)用数学模型分析所检测到的TAP1基因遗传变异与血清免疫指标的关联性，并分析品种间血清免疫指标的差异性。旨在寻找与安徽地方猪种抗病性状相关的有效遗传标记，为安徽地方猪种质资源特性及抗病育种研究提供分子生物学参考。

主权项

一种安徽地方猪种抗病性状候选遗传标记的筛选方法，其特征在于：包括如下步骤：(1)对照动物模型的选择：选择安徽省地方猪种圩猪、皖南黑猪、霍寿黑猪与外来猪种大白猪28日龄断奶的仔猪为研究免疫指标品种差异的对照动物模型；(2)样品采集：仔猪35日龄时，采集耳样组织并空腹采血；(3)耳样组织DNA提取；(4)PCR扩增抗原处理相关转运体1即TAP1基因目的片段；(5)目的片段单链构象多态性即SSCP分析；(6)PCR扩增产物双向测序；(7)群体遗传学特性分析；(8)仔猪血清免疫指标的测定；(9)采用数学模型分析所检测到的TAP1基因的遗传变异与血清免疫指标的关联性，并分析品种间血清免疫指标的差异性；根据TAP1基因单核苷酸多态性即single nucleotide polymorphism：SNP与免疫指标的关联性分析，探讨所检测到的SNP位点对不同猪群断奶仔猪抗病性的指标是否有影响，从而判定所检测到的SNP位点能否作为仔猪抗病育种的有效标记位点。