单链抗体的基于序列的工程改造和最优化

摘要

本发明提供了使用基于序列的分析和合理的(rational)策略修饰和提高单链抗体(svFv)的结构和生物物理特性包括稳定性、溶解性和抗原结合亲和力的方法。可单独地或组合地使用此类方法和策略。本发明的方法还包括数据库的用途，所述数据库包含来自实验筛选的抗体的scFv文库的scFv序列(其因具有优良的溶解性和稳定性而被选择)。本发明还提供了这样的方法，所述方法将针对此类被选择的抗体发现的特性用于重塑svFv抗体以提高单链抗体片段的稳定性和溶解性特性的一般方法。

主权项

鉴定单链抗体(scFv)中用于突变的一个或多个框架氨基酸位点的方法，所述scFv具有VH和VL氨基酸序列，该方法包括：a)提供VH、VL或VH和VL氨基酸序列的第一数据库；b)提供因具有至少一个期望的功能特性而被选择的scFv抗体VH、VL或VH和VL氨基酸序列的第二数据库；c)测定第一数据库的各框架位点和第二数据库的各框架位点上的氨基酸变异性；d)鉴定在其上氨基酸变异性的程度在第一数据库和第二数据库之间不同的一个或多个框架位点，从而鉴定单链抗体(scFv)中用于突变的一个或多个框架氨基酸位点。