出生缺陷靶向寡核苷酸微阵列比较基因组杂交芯片的制备方法

摘要

本发明涉及诊断试剂领域，提供了一种出生缺陷靶向寡核苷酸微阵列比较基因组杂交芯片的制备方法。由本发明所述方法制备的出生缺陷靶向寡核苷酸微阵列比较基因组杂交芯片是由靶向特定的染色体或染色体区域的探针构建而成，既能保证病理性CNVs的检出又可以大大减少临床意义不明的CNVs的检出。

主权项

1、一种出生缺陷靶向寡核苷酸微阵列比较基因组杂交芯片的制备方法，包括以下步骤：1)出生缺陷基因组拷贝数变化靶点筛查与鉴定a.收集确诊为发育迟缓、智力低下或多发先天下畸形病例以及经超声检测为先天异常的胎儿病例；b.采用高分辩率全基因组微阵列比较基因组杂交芯片进行检测，每例标本经染料互换共检测两次；c.杂交结果扫描和分析；d.对检测出的基因组拷贝数变化用FISH、定量PCR或MLPA进行验证；e.鉴定并记录与特定畸形表型相关的基因组拷贝数变化；2)靶点的选择：将经上述检测所得到的基因组畸变区域和国际病理性基因组拷贝数变化数据库最新检测和确定的所有微缺失和微复制综合征的基因组畸变区域共同作为本芯片的靶点；3)探针的选择：选择靶向上述靶点的探针、质量控制探针和阴性对照探针，探针长为50至70bp，相邻靶向探针的间距为6.3至6.5Kb；4)玻片表面经硅化处理：对玻片进行表面硅化处理，以有利于探针牢固地结合于载体表面；5)点样：将靶向探针随机点于玻片上，每个探针重复4次，共分4个区块，每个区块都点有重复的质量控制探针和阴性对照探针。