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Die Erfindung betrifft Verfahren zur Erzeugung von Polynukleotidmolekülen mit veränderten Eigenschaften, wobei mindestens ein Zyklus, umfassend die folgenden Schritte durchlaufen wird: DOLLAR A (a) Bereitstellung eines doppelsträngigen Polynukleotidmoleküls oder einer Population doppelsträngiger Polynukleotidmoleküle, wobei die einzelnen Polynukleotide dieser Population mindestens einen homologen Sequenzabschnitt und mindestens einen heterologen Sequenzabschnitt besitzen, DOLLAR A (b) Erzeugung von Einzelstrangbrüchen in den doppelsträngigen Polynukleotidmolekülen, DOLLAR A (c) nukleolytischer Abbau in 5'->3'Richtung, ausgehend von den Einzelstrangbrüchen bei gleichzeitiger Neusynthese in 5'->3'Richtung unter Verschiebung der Einzelstrangbrüche in Richtung des 3'-Endes, DOLLAR A (d) Herstellung einzelsträngiger Polynukleotidmolekülen, DOLLAR A (e) Herstellung von partiell doppelsträngigen Polynukleotidmolekülen der aus Schritt (d) bereitgestellten einzelsträngigen Polynukleotidmolekülen, DOLLAR A (f) template-gerichtete Nukleinsäuresynthese, ausgehend von den in Schritt (e) hergestellten partiell doppelsträngigen Polynukleotidmolekülen, DOLLAR A wobei die Schritte (b) und (c) nacheinander oder gleichzeitig ausgeführt werden können.
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