一种用于检测Her2基因不含重复序列的FISH探针、试剂盒及其检测方法

摘要

本发明属于生物技术领域，公开了一种用于检测Her2基因不含重复序列的荧光原位杂交探针、试剂盒及其检测方法。以Her2基因为模板，对Her2基因中的非重复序列进行聚合酶连反应，扩增产物为350～800碱基对大小不等的DNA片段，消除Her2基因中的重复序列，从而形成不含重复序列的产物，产物经过荧光标记后获得Her2基因不含重复序列荧光原位杂交探针，用于Her2基因荧光原位杂交检测。本发明获得的Her2基因荧光原位杂交探针可消除重复序列，显著降低Her2基因荧光原位探针的非特异性背景信号，提高荧光原位杂交探针的特异性。

主权项

一种用于检测Her2基因不含重复序列的FISH探针，其特征在于，所述FISH探针DNA以Her2基因和着丝粒序列为模板，利用27对PCR引物组或与引物组具有同一性的核苷酸序列，进行PCR扩增反应制备得到，其中1~26对引物组为Her2 基因PCR引物组，第27对引物组为STR序列PCR引物组，所述27对引物组为：1 F：5'  GGTTGGAATGAGTAAGAAGTAGC  3'1 R：5'  TAGGAATTTTCTAAAGGGGAGAC  3' 2 F：5'  AGGTTAATGGTGGAAGTGGG  3'2 R：5'  ACACTCTACTATTAACATATGC  3' 3 F：5'  TTTACTTTGGCTGCTGTTGC  3'3 R：5'  ATATTTTCGGATTTGGTATAGG  3' 4 F：5'  TGGCTGTAGGTCAGAGTGGC  3'4 R：5'  AAGGATAAGGTGGAGTTTTGT  3'  5 F：5'  TGGGTGATGGAATGATCTGG  3'5 R：5'  ACGAGTCTCCGAACAAAAGG  3' 6 F：5'  AAAAGAAAACCAATGGGACAG  3'6 R：5'  CCCACGCCAACATAAATACAC  3' 7 F：5'  TCCTCCCTCTTTGTCCTTATC  3'7 R：5'  AAAGTGCCCAGTTGAACTTGTT  3' 8 F：5'  CTTTGTGGCAGCAGTTTCGT  3'8 R：5'  AGAGCAGATGGGTCAGAGGAC  3' 9 F：5'  GTGGTGGGACTCAAAGACGG  3'9 R：5'  AGGAAATGGGTGGTGTAGGC  3' 10 F：5'  CCCTAGAAGGTGATGCTGATG  3'10 R：5'  ATATGCTCCCATTTACAGAAAC  3' 11F：5'  CCAGCCCACCCTGTCCTAT  3'11R：5'  TGCCCACTCTTACCCATCAA  3' 12F：5'  CCAGCCCACCCTGTCCTA  3'12R：5'  TTCTGTCTCCTGCCATCCC  3' 13F：5'  TGCCTGACCTCAGCGTCTT  3'13R：5'  GGTGGGTGTTATGGTGGATG  3' 14F：5'  ACACCCACCTCTGCTTCGT  3'14R：5'  TGCCTTCACTCAAACCCTTT  3' 15F：5'  TGGGTGAAGAGCAAGGGTG  3'15R：5'  GAGTGGGTGCAGTTGATGG  3' 166F：5'  CCAGGAGCATGGCGAAAA  3'16R：5'  AAGAGCCCCAGAAAGACCC  3' 17F：5'  CTCACTTTCCAGAACCTT  3'17R：5'  TTATTTGACTCGACCTAA  3' 18F：5'  CCTTCATTGCCCTTCACTC  3'18R：5'  CCTAGCCATCTTTCCTTGC  3' 19F：5'  ATGTCTTCAAAGTTCTGGTG  3'19R：5'  AGATAGTGCATCCTGGGA  3' 20F：5'  GGGTGGTGAAGGATGTTTG  3'20R：5'  TAGTCTAGGTTTGCGGGAGT  3' 21F：5'  GCCCTATGGCTGCCTCTTA  3'21R：5'  CTCTGCTCCTTGGTCCTTCAC  3' 22F：5'  TATGCCCTATGGCTGCCTCT  3'22R：5'  TGGTCCTTCACCTAACCTTGC  3' 23F：5'  GGTCTGTCTCCTGGCATCAC  3'23R：5'  ACATCCTGGTCCCCTTTCA  3' 24F：5'  ACAGGCACCGCAGCTCAT  3'24R：5'  CGCCACTCTGGGGACAAG  3' 25F：5'  TCTCCACTGGCACCCTCC  3'25R：5'  GACGACCCCATTCTTCCCT  3' 26F：5'  CTTCAAAGGGACACCTACGG  3'26R：5'  CAAAGCCTGGATACTGACACC  3'； 27F：5'  GGCACGGTGGCTCACGCCTGTAAT  3'27R：5'  GGGAGGCTAAGTTCCTTGTTCG  3' 所述27对PCR引物组的5’端插入通用标签序列：CGCTTTACTGACGCGTTGC。