| 摘要 |
Данное изобретение относится к способам идентификации областей, склонных к агрегации, в структурированных (свернутых) белках и к связанным способам определения склонности белка к агрегации, к коду компьютерной программы и оборудованию для осуществления способов, и к связанным способам идентификации новых лекарственных средств и мишеней лекарственных средств, а также белковой токсичности. Способ идентификации одной или более областей в аминокислотной последовательности белка, в отношении которых предсказывается, что в свернутом белке они содействуют агрегации, где способ включает определение, для аминокислотных положений (i) в указанной последовательности, локальной склонности к агрегации (А) в указанном аминокислотном положении, указанную локальную склонность к агрегации устанавливают посредством комбинирования значения гидрофобности, значения склонности к образованию α-спирали, значения склонности к образованию β-слоя, значения заряда и значения вклада в паттерн для указанного аминокислотного положения; определение значений локальной структурной стабильности для указанных аминокислотных положений, причем указанное значение локальной структурной стабильности включает меру локальной структурной стабильности в указанном аминокислотном положении; и комбинирование указанных установленных локальных склонностей к агрегации в указанных аминокислотных положениях и указанных значений локальной структурной стабильности в указанных аминокислотных положениях для того, чтобы идентифицировать одну или более областей в указанной аминокислотной последовательности, в отношении которых предск |
